关于“分公司的资质总公司能否使用”的问题，这主要涉及到公司法以及招投标活动的相关规定。
首先，我们需要明确分公司与子公司在法律地位上的区别。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司是总公司的分支机构，它不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。而子公司则是具有独立法人资格的公司，它依法独立承担民事责任，与母公司（即总公司）在法律上是相互独立的个体。
接下来，我们针对问题本身进行解答：
总公司能否使用分公司的资质：
- 在招投标采购活动中，如果评分标准没有特别要求，总公司是可以使用分公司的企业特别资质（如医疗机构执业许可证）、业绩、设备和人员证明的。这是因为分公司作为总公司的分支机构，其资质和业绩在某种程度上可以视为总公司的资质和业绩的一部分。但需要注意的是，这种使用通常需要在招标文件中有明确规定或者得到采购人的认可。
分公司投标时的资质认定：
- 当分公司参加投标时，其资质、业绩、设备和人员证明的认定通常由采购人在招标文件中作出规定。如果招标文件没有明确规定，那么总公司的资质、业绩、设备和人员证明在分公司投标时应该予以认定，前提是这些资质和业绩与分公司所投项目相关且符合招标文件的要求。
特殊情况下的处理：
- 如果分公司工作人员均由总公司进行合同签订及社保缴纳，那么在分公司投标时，在总公司授权的前提下，提供总公司签订的合同及社保证明是可以被认可的。这是为了证明分公司的人员配置和社保缴纳情况，从而增强其投标资格的可信度。
综上所述，总公司是可以使用分公司的资质参与政府采购活动的，但具体使用方式和认可程度可能因招标文件的规定和采购人的要求而有所不同。因此，在实际操作中，建议仔细阅读招标文件，了解采购人的具体要求，并在必要时咨询专业法律人士或招投标专家的意见。