自离工资会扣多少并没有一个固定的答案，它取决于多种因素，包括是否给用人单位造成经济损失、劳动合同的具体约定以及当地的法律法规等。以下是对此问题的详细分析：
无经济损失情况：
- 如果劳动者自动离职，但并未给用人单位造成任何经济损失，用人单位是无权扣除劳动者工资的。工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，用人单位应按时足额支付。
- 即使劳动者未按照正常离职程序办理手续，用人单位也只能依据合法有效的规章制度，对其旷工等行为进行适当处理，如扣除当天旷工的工资（若规章制度有此规定且合法合理），但不能随意大幅扣减工资。例如，若劳动者当天未出勤，用人单位可依据规章制度扣除当天工资，但不得因此扣除其他正常出勤日期的工资。
造成经济损失情况：
- 如果因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，如未完成工作交接导致项目停滞、数据丢失，或违反保密协议、竞业限制协议给公司带来损失等，用人单位有权要求劳动者赔偿。
- 经济损失的赔偿可以从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。计算公式为：
- 每月可扣除的最大金额 = 当月工资 × 20%
- 扣除后应支付的最低工资 = 当地月最低工资标准（若扣除后的工资低于此标准）
劳动合同与公司规章制度：
- 劳动合同中可能包含关于自离或旷工的特别约定，如自离需支付违约金或赔偿金等。但这些约定必须合法合理，且不得违反劳动法的强制性规定。
- 公司规章制度中也可能对自离或旷工的扣罚标准有明确规定。这些规定必须经过民主程序制定，且不得与劳动法相冲突。劳动者在签订劳动合同时应仔细阅读相关条款，了解自己的权利和义务。
维权途径：
- 若劳动者认为用人单位克扣工资不合理，首先应与用人单位协商解决。协商不成的，可以向劳动监察部门投诉，寻求行政部门的帮助。
- 如果投诉未能解决问题，劳动者可以申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
建议：
- 劳动者在自离前应了解公司的规章制度和劳动合同的相关约定，尽量遵守正常离职程序，做好工作交接，以减少不必要的纠纷和损失。
- 用人单位在扣除工资时，必须有明确的法律依据或合同约定，并且要遵循法定程序，确保劳动者的合法权益不受侵害。
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