部队休假回来偷偷结婚并不违法。不过，我们可以从多个角度来详细分析这个问题：

1. 结婚的合法性：

   • 根据我国《民法典》的相关规定，只要男女双方达到法定婚龄（男不得早于二十二周岁，女不得早于二十周岁），自愿结婚，并且没有禁止结婚的亲属关系（如直系血亲或者三代以内的旁系血亲），也没有患有医学上认为不应当结婚的疾病，那么他们的婚姻就是合法的。
   • 在这个案例中，如果部队休假回来的军人满足上述条件，并且与另一方自愿结婚，那么他们的婚姻就是合法的，无论是否“偷偷”进行。

2. “偷偷结婚”的含义与影响：

   • “偷偷结婚”可能指的是没有告知某些人（如父母、亲友或部队领导）而结婚。这种行为本身并不违反法律，但可能涉及道德或家庭关系的问题。
   • 从法律角度来看，婚姻的合法性并不取决于是否告知了所有人。只要满足了结婚的法定条件，婚姻就是有效的。
   • 然而，如果因为“偷偷结婚”而导致了家庭矛盾或其他问题，那么这可能需要通过沟通、协商或法律途径来解决。

3. 部队对军人结婚的特殊规定：

   • 部队对军人结婚可能有一些特殊的规定或程序，如需要提前报告、申请结婚函调等。这些规定主要是为了确保军人的婚姻符合军队的要求和标准。
   • 如果军人没有按照部队的规定进行结婚登记或报告，可能会受到部队的纪律处分。但这并不影响婚姻的合法性，只是军人可能需要承担相应的纪律责任。

建议：

• 如果你是部队休假回来的军人，打算结婚，建议提前了解部队的相关规定和程序，确保自己的婚姻既合法又符合军队的要求。
• 如果因为“偷偷结婚”而导致了家庭矛盾或其他问题，建议积极与相关人员沟通、协商，寻求妥善的解决方案。
• 如果在处理这些问题过程中遇到法律难题或需要法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。