结论：对司法鉴定结果有异议，两年后一般不能直接起诉要求重新鉴定或推翻原鉴定结果，但可以在相关诉讼中提出异议并申请重新鉴定，具体需视诉讼时效和案件具体情况而定。

分析说明：

1. 诉讼时效问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，民事权利受到侵害后，受害人应在法定的诉讼时效期间内提起诉讼。一般来说，普通诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但针对司法鉴定结果的异议，并不直接适用这一诉讼时效来“起诉”鉴定结果本身，因为鉴定结果通常是诉讼中的一个证据或环节。
   • 如果是因为司法鉴定结果导致的损害赔偿等民事纠纷，那么应当在知道或应当知道损害发生之日起三年内提起诉讼。但这里的关键是，起诉的是因鉴定结果引发的民事纠纷，而非直接起诉鉴定结果。

2. 对司法鉴定结果的异议处理：

   • 在诉讼过程中，如果一方对司法鉴定结果有异议，通常应当在法庭指定的期限内提出，并可以申请重新鉴定。法庭会根据案件具体情况和鉴定机构的资质、鉴定程序的合法性等因素，决定是否准许重新鉴定。
   • 如果是在诉讼外对司法鉴定结果有异议，一般不能直接通过起诉来推翻原鉴定结果。但可以在后续的相关诉讼中，作为证据提出异议，并申请法院委托新的鉴定机构进行重新鉴定。

3. 两年后的处理：

   • 如果已经超过了相关民事纠纷的诉讼时效期间，且没有其他诉讼正在进行中，那么一般无法再直接通过诉讼来处理对司法鉴定结果的异议。
   • 但如果仍在诉讼时效期间内，或者正在进行的相关诉讼中涉及到了该司法鉴定结果，那么仍然可以提出异议并申请重新鉴定。

行动建议：

• 如果您对司法鉴定结果有异议，且认为该结果影响了您的合法权益，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律途径和诉讼策略。
• 在诉讼过程中，及时提出对司法鉴定结果的异议，并按照法庭的要求提供相关证据和材料，申请重新鉴定。
• 注意保留好与司法鉴定相关的所有证据和材料，以便在后续的法律程序中使用。

法律后果：

• 如果未能在法定的诉讼时效期间内提起诉讼或提出异议，可能会丧失通过法律途径维护自己合法权益的机会。
• 如果提出的异议被法庭采纳并准许重新鉴定，那么新的鉴定结果可能会成为案件判决的重要依据。