合同章编号和公章编号相同，在大多数情况下，并不会直接导致严重的法律后果或问题，但这种情况确实比较罕见，且可能引发一些管理和使用上的混淆。以下是对此问题的详细分析：

1. 编号的差异性：

   • 在实践操作中，合同专用章与公章的编码往往并不完全相同。这是因为刻章店铺通常会为每一次刻章业务配备相应的编码，以区分不同的刻制对象。例如，同一家公司的公章和财务专用章，可能会有不同的编码。

2. 编码的防伪功能：

   • 对于那些自带编码的公章，业内通常称之为“编码防伪公章”。这种编码有助于识别公章的真伪，并防止公章被滥用或伪造。

3. 合同章与公章的用途：

   • 合同章主要用于签订各类合同，而公章则具有更广泛的用途，如代表公司出具各类文件、证明等。因此，尽管两者的编码可能相同，但它们的用途和法律效力是不同的。

4. 可能引发的问题：

   • 如果合同章和公章的编号相同，可能会在管理上造成一定的混淆。例如，在归档或查找特定文件时，可能会因为编码相同而难以区分是合同还是其他类型的文件。
   • 此外，如果公章被用于非法或不当用途，而合同章又与其编码相同，可能会给调查带来一定的困难。

5. 建议：

   • 为了避免混淆和潜在的风险，建议公司在刻制公章和合同章时，选择不同的编码。
   • 同时，应建立完善的印章管理制度，明确各类印章的用途、保管人和使用流程，确保印章的安全和合规使用。

综上所述，合同章编号和公章编号相同并不会直接导致严重的法律后果，但可能会引发一些管理和使用上的混淆。因此，建议公司在刻制和使用印章时，注意区分不同的编码和用途，以确保印章的合规性和安全性。