关于农民工保证金由谁来交的问题，这主要依据地方的具体规定来执行。以河南省为例，根据最新的《河南省工程建设领域农民工工资保证金实施办法》，农民工工资保证金是由施工总承包企业来缴存的，建设单位不再需要缴存。

这一变更旨在更好地发挥工资保证金在解决工程建设领域欠薪问题上的兜底保障作用。该《实施办法》不仅明确了施工总承包企业作为缴存主体的责任，还进一步细化了农民工工资保证金制度实施中的相关事项。例如，省市人社部门负责组织实施工资保证金制度，并会同行业工程建设主管部门对施工总承包企业缴存工资保证金的情况进行监管。

此外，河南省还在全国率先推行了有利于企业合理安排建设资金的农民工工资保证金保函替代制度，并强化了应急处理机制。在拖欠农民工工资引发突发事件时，可以简化工作流程，确保保证人能在24小时内赔付到位。

总的来说，农民工保证金的缴存主体和具体规定可能因地区而异。因此，建议在实际操作中，根据所在地的具体政策和规定来确定缴存主体和流程。如果您对其他地区的农民工保证金缴存规定有疑问，建议咨询当地的人社部门或相关主管部门以获取准确信息。