虚开普通发票15万元、数量55份且被抵扣的，已达到刑事立案标准，公安机关应当立案侦查。具体分析如下：

1. 立案标准依据
   根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）的补充规定》第二条，虚开发票案的立案标准为：

   • 虚开发票金额累计在40万元以上，或
     
   • 虚开发票数量累计在50份以上，或
     
   • 5年内因虚开发票受过行政处罚2次以上又虚开发票的。
     本案中，虚开发票数量达55份，已满足“数量标准”，无论金额是否达到40万元，均构成刑事立案条件。

2. “被抵扣”的加重情节
   若虚开的普通发票被用于抵扣税款（如虚构交易骗取出口退税、抵扣进项税额等），可能同时触犯《刑法》第二百零五条之一虚开发票罪与第二百零四条骗取出口退税罪或第二百零一条逃税罪的竞合。此时：

   • 公安机关会以虚开发票罪立案，但若查实存在骗税或逃税目的，可能按重罪（如骗取出口退税罪）定罪处罚；
     
   • 即使未达逃税罪的刑事立案标准（如逃税金额未达10万元），虚开发票行为本身仍可独立构成犯罪。

3. 法律后果

   • 刑事处罚：虚开发票罪可处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的（如虚开金额巨大、造成国家税款重大损失），处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 行政处罚：即使未被追究刑事责任，税务机关可依据《发票管理办法》第三十七条，处5万元以上50万元以下罚款，并没收违法所得。

4. 实务建议

   • 若已收到税务机关《税务处理决定书》或《税务行政处罚决定书》，需在规定期限内履行义务（如补缴税款、缴纳罚款），否则可能触发刑事程序；
     
   • 若尚未被立案，可主动向税务机关说明情况、补缴税款，争取从轻处理（如不移送公安机关）；
     
   • 若已被立案，建议尽快委托律师介入，通过审查发票流向、资金回流等证据，争取认定为“单位犯罪”或“从犯”，以降低量刑幅度。

提示：虚开发票行为是否构成犯罪，需结合发票类型（专票/普票）、金额、数量、用途等综合判断。若涉及跨区域虚开、团伙作案等情节，可能被认定为“情节特别严重”，量刑将显著加重。如有进一步细节需分析，可直接向我咨询。