公司倒闭后，已起诉的刑事案件原则上不会因公司倒闭而终止，案件会继续由司法机关依法处理。以下是具体分析：

1. 刑事案件的独立性
   刑事案件的追诉主体是国家（检察院），其核心目的是打击犯罪、维护社会秩序，与公司的民事主体资格是否存续无直接关联。即使公司倒闭（如破产清算、注销登记），已立案的刑事案件仍会继续推进，不会因公司状态变化而自动终止。

2. 公司倒闭对案件的影响

   • 侦查阶段：若公司被立案侦查，警方会继续调查犯罪事实，收集证据，锁定嫌疑人（如公司高管、直接责任人）。公司倒闭不影响侦查程序，但可能因公司财务资料、业务记录等灭失增加调查难度。
     
   • 审查起诉阶段：检察院会审查证据是否充分，决定是否提起公诉。即使公司已注销，检察院仍可对涉案个人（如实际控制人、直接责任人）提起公诉。
     
   • 审判阶段：法院会依法审理案件，判决责任人承担刑事责任（如罚金、有期徒刑）。若公司财产已用于清偿债务，可能影响罚金执行，但不影响定罪量刑。

3. 特殊情形处理

   • 单位犯罪的认定：若案件涉及单位犯罪（如公司集体决策实施犯罪），公司倒闭后，检察院可能直接追究直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事责任，不再以单位为被告。
     
   • 财产执行问题：若判决涉及罚金或没收财产，但公司已无财产可供执行，法院可能中止执行，待发现财产后恢复执行；若涉及个人责任，则执行个人财产。

4. 实务建议

   • 涉案个人：若您是公司员工或高管，且可能涉及刑事责任，建议主动配合调查，委托律师辩护，争取从轻处理（如自首、立功）。
     
   • 债权人/投资者：若您是公司债权人或投资者，刑事案件的推进可能帮助追回部分损失（如赃款赃物追缴），但需通过刑事附带民事诉讼或另行提起民事诉讼主张权利。
     
   • 清算组/管理人：若您参与公司清算，需配合司法机关提供涉案资料，避免隐匿、毁灭证据导致法律风险。

总结：公司倒闭不会导致刑事案件“消失”，司法机关会依法追究涉案个人的责任。若您是案件相关方，建议根据自身角色（嫌疑人、债权人等）采取相应措施，必要时委托律师介入。如有具体问题，可进一步向我咨询。