保证书和协议书的电子版在符合法定条件的情况下是有效的。以下从不同角度为你详细分析：
从法律认可电子合同效力的角度
根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条的规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。
保证书和协议书本质上属于合同范畴，只要其内容符合法律规定，双方当事人意思表示真实，且以电子数据交换、电子邮件等符合法律规定的电子形式呈现，能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用，那么该电子版的保证书和协议书就具有法律效力。例如，甲乙双方通过电子邮件的方式签订了一份借款保证书，邮件中明确载明了保证的范围、方式、期限等关键条款，且双方都进行了确认，这份电子版的保证书就是有效的。
从电子签名合法性的角度
《中华人民共和国电子签名法》第三条规定，民事活动中的合同或者其他文件、单证等文书，当事人可以约定使用或者不使用电子签名、数据电文。当事人约定使用电子签名、数据电文的文书，不得仅因为其采用电子签名、数据电文的形式而否定其法律效力。同时，该法还规定了可靠的电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力。
如果保证书和协议书的电子版中使用了可靠的电子签名，那么其法律效力就等同于纸质版上签字或盖章的效力。可靠的电子签名需要满足电子签名制作数据用于电子签名时，属于电子签名人专有；签署时电子签名制作数据仅由电子签名人控制；签署后对电子签名的任何改动能够被发现；签署后对数据电文内容和形式的任何改动能够被发现等条件。例如，在一些专业的电子合同平台上签订的保证书和协议书，通常会采用符合法律规定的电子签名技术，这样的电子版文件就是合法有效的。
从实际履行和证据效力的角度
即使保证书和协议书是电子版的，只要双方当事人按照约定实际履行了各自的义务，那么该电子版文件在实际履行过程中也会被视为有效的证据。在发生纠纷时，电子版的保证书和协议书可以作为证明双方权利义务关系的重要依据。不过，为了增强电子版文件的证据效力，建议采取一些措施，如对电子文件进行公证、保存好相关的电子数据传输记录等。
注意事项：
如果你在保证书和协议书的签订、履行过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。