核心结论：在电动车自行车与机动车碰撞导致机动车损坏的情况下，赔偿问题需根据事故责任划分来确定，交强险（即您所说的加强险）的赔偿也有其特定规则。以下是详细说明：
事故责任划分：
- 首先，需要由交警部门出具事故责任认定书，明确双方的责任比例。这是后续赔偿的基础。
- 如果电动车自行车被认定为全责或主要责任，那么机动车的损坏赔偿将主要由电动车自行车方承担。
- 如果机动车被认定为有责任（如次要责任或同等责任），则机动车方也需要承担相应的赔偿责任。
交强险赔偿规则：
- 交强险是机动车必须购买的强制保险，其赔偿范围包括财产损失赔偿限额，目前这一限额通常为2000元。
- 在事故中，如果机动车有责任，那么交强险将在财产损失赔偿限额内对对方的损失进行赔偿。但需要注意的是，交强险不赔偿本车（即机动车）的损失。
- 如果机动车无责任，交强险也有无责任财产损失赔偿限额，但这一限额通常较低，且同样不赔偿本车损失。
机动车损坏的赔偿：
- 对于机动车的损坏，如果电动车自行车方有责任，且其购买了相应的保险（如非机动车第三者责任险），则可以通过保险进行赔偿。
- 如果电动车自行车方没有购买保险或保险赔偿不足，那么机动车方可以通过协商、调解或诉讼等方式要求电动车自行车方进行赔偿。
- 如果机动车方也有责任，那么其需要承担自己车辆损失的一部分或全部，具体取决于责任比例。这部分损失可以通过机动车方的车损险（如果购买了）进行赔偿。
特殊情况说明：
- 如果电动车自行车被认定为机动车（如超标电动车），则事故将按照机动车之间的事故处理，交强险的赔偿规则也将相应调整。
- 在处理事故时，建议双方及时报警并保留好相关证据，如事故现场照片、视频、交警责任认定书等，以便后续赔偿处理。
建议：
- 在处理此类事故时，建议双方保持冷静，通过合法途径解决赔偿问题。
- 如果对赔偿问题有争议或无法达成一致，可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即我）以获取更具体的法律建议。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。