针对您提出的“体制内违规经商办企业怎么处理”这一问题，我将结合相关法规和政策，为您进行详细解答。
首先，需要明确的是，党和国家机关违反有关规定经商办企业，是明确违反党的廉洁纪律的行为。这一行为不仅影响党和国家机关公正执行公务，还严重损害党和国家机关的清廉公正形象。
一、法规依据
根据《中国共产党纪律处分条例》第一百零八条的规定，党和国家机关违反有关规定经商办企业的，对直接责任者和领导责任者，将给予警告或者严重警告处分；情节严重的，还将给予撤销党内职务处分。这一规定为处理此类违规行为提供了明确的法律依据。
二、历史背景与政策沿革
为了维护党和国家机关的清廉形象，党中央、国务院早在1984年就发出了《关于严禁党政机关和党政干部经商、办企业的决定》，并在1986年进一步发出《关于进一步制止党政机关和党政干部经商、办企业的规定》。这些规定明确禁止党政机关，包括各级党委机关和国家权力机关、行政机关、审判机关、检察机关以及隶属这些机关编制序列的事业单位，一律不准经商、办企业。此后，相关政策不断细化和完善，如1993年中共中央办公厅、国务院办公厅转发国家经贸委《关于党政机关与所办经济实体脱钩的规定》，以及1998年中共中央办公厅、国务院办公厅印发《关于中央党政机关与所办经济实体和管理的直属企业脱钩有关问题的通知》等。
三、处理原则与措施
责任追究：对于违规经商办企业的行为，将追究直接责任者和领导责任者的责任。这意味着，不仅具体操作人员会受到处分，相关领导也可能因管理不善或纵容包庇而承担责任。
处分措施：根据违规情节的轻重，处分措施包括警告、严重警告、撤销党内职务等。这些处分措施旨在起到警示和惩戒作用，防止类似行为再次发生。
整改要求：除了对责任人员进行处分外，还可能要求违规经商办企业的机关进行整改，包括停止违规行为、清理相关资产、恢复机关正常职能等。
四、实际案例与警示
在实际操作中，已经有多起党政机关违规经商办企业的案例被查处。这些案例不仅涉及金额巨大，而且严重损害了党和国家机关的形象和公信力。因此，各级党政机关和工作人员必须严格遵守相关规定，不得违规经商办企业。
五、建议与展望
为了防止类似违规行为的发生，建议各级党政机关加强内部管理，完善监督机制，确保工作人员严格遵守廉洁纪律。同时，也应加强对相关法规政策的宣传和教育，提高工作人员的法律意识和纪律观念。
综上所述，体制内违规经商办企业是严重违反党的廉洁纪律的行为，必须受到严肃处理。各级党政机关和工作人员应严格遵守相关规定，共同维护党和国家机关的清廉形象。