结论：贩卖替来烟弹金额不到1000元，若构成刑事妨碍药品管理，是有可能被起诉的，但具体是否起诉需结合案件具体情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、法律定性
刑事妨碍药品管理罪的构成：
- 根据相关法律法规，刑事妨碍药品管理罪通常涉及非法生产、销售、使用药品等行为，且这些行为需达到一定的严重程度，如危害公共健康、造成严重后果等。
- 贩卖替来烟弹，如果替来烟弹被认定为药品，且贩卖行为违反了药品管理法规，那么可能构成刑事妨碍药品管理罪。
金额与犯罪构成的关系：
- 金额不是决定是否构成犯罪的唯一因素，但它是衡量犯罪严重程度的一个重要指标。
- 即使金额不到1000元，如果贩卖行为具有其他严重情节，如多次贩卖、向未成年人贩卖、贩卖假药或劣药等，仍然可能构成犯罪。
二、起诉的可能性
检察机关的起诉标准：
- 检察机关在决定是否起诉时，会综合考虑犯罪事实、证据、犯罪嫌疑人的社会危险性、犯罪情节等多个因素。
- 如果贩卖替来烟弹的行为被认定为犯罪，且证据充分，检察机关有可能会提起公诉。
案件具体情况的影响：
- 案件的具体情况，如贩卖数量、贩卖对象、贩卖方式、是否造成危害后果等，都会影响检察机关的起诉决定。
- 如果贩卖行为情节轻微，社会危害性不大，检察机关可能会作出不起诉决定。
三、法律建议
立即停止贩卖行为：
- 如果您或您认识的人正在贩卖替来烟弹，应立即停止该行为，以避免进一步的法律风险。
咨询专业律师：
- 在面对可能的法律纠纷时，咨询专业律师是非常重要的。律师可以根据您的具体情况，为您提供法律意见和辩护策略。（当然，作为李远祥律师，我随时准备为您提供专业的法律咨询和辩护服务。）
配合调查：
- 如果已经被相关部门调查或传唤，应积极配合调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
四、可能的法律后果
刑事处罚：
- 如果构成刑事妨碍药品管理罪，可能会面临有期徒刑、拘役、罚金等刑事处罚。
行政处罚：
- 即使不构成犯罪，贩卖替来烟弹的行为也可能违反药品管理法规，面临行政处罚，如罚款、没收违法所得、吊销许可证等。
总结与进一步思考：贩卖替来烟弹金额不到1000元，是否会被起诉取决于多种因素，包括行为的法律定性、案件的具体情况、检察机关的起诉标准等。因此，无法仅凭金额就判断是否会被起诉。如果您或您认识的人面临类似情况，建议立即停止贩卖行为，并咨询专业律师以获取更具体的法律意见。如果您有任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会尽我所能为您提供帮助。