针对您提出的“停运损失费被告法院怎么处理”的问题，我将从法律依据、停运损失的确定与计算、以及诉讼流程三个方面为您详细解答。

一、法律依据

停运损失的赔偿在法律上有明确的依据。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，侵害他人财产的，财产损失应按照损失发生时的市场价格或其他合理方式计算。对于因违约或侵权导致的停运损失，受损方有权依法请求侵权人或违约方进行赔偿。此外，最高人民法院的相关司法解释也明确规定了，因道路交通事故等造成的经营性活动车辆停运损失，当事人请求赔偿的，人民法院应予支持。

二、停运损失的确定与计算

1. 停运时间的确定： 法院在确定停运时间时，会综合考虑车辆的实际维修时间、交通管理部门扣车进行检验、鉴定的时间，以及合理的恢复营运准备时间。维修记录、检验鉴定报告等是确定停运时间的重要依据。

2. 停运损失计算标准：

   • 收入计算：法院会综合考虑受损车辆的以往营运收入情况，如财务报表、营运记录，以及同行业、同类型车辆的平均收入水平，来确定预期收入。
   • 成本扣除：在计算停运损失时，需扣除停运期间未实际发生的可变成本，如燃料费、维修保养费等。但固定成本，如折旧费、保险费等，通常不予扣除。

3. 证据要求： 申请赔偿时，您需要提供相关证据来证明停运损失的具体数额，如维修记录、营运收入证明、同行业收入水平参考等。

三、诉讼流程

如果您决定通过法律途径来维护自己的权益，以下是一个基本的诉讼流程指南：

1. 准备阶段：

   • 明确诉讼主体：确定原告（受损方）和被告（侵权人或违约方）。
   • 收集证据：包括事故证明材料、运营资格证明、停运时间证明、收入证明和运营成本证明等。
   • 确定诉讼请求和赔偿金额：明确要求被告赔偿的停运损失费及相关费用，并依据上述计算标准合理确定赔偿金额。
   • 聘请律师：考虑法律程序的复杂性和专业性，建议聘请律师提供法律意见、整理证据、起草诉讼文书及进行法庭辩论。

2. 诉讼程序：

   • 立案：向有管辖权的人民法院提交起诉状和证据，缴纳诉讼费用。
   • 审理阶段：包括送达与答辩、法庭调查、法庭辩论等环节。您需要详细阐述停运损失及计算依据，出示证据；被告则有权质疑、反驳并提交证据。
   • 判决与执行：法院根据事实和法律作出判决。如果判决生效后被告未履行赔偿义务，您可以申请强制执行。

3. 注意事项：

   • 诉讼时效：请务必把握诉讼时效，避免超过时效而丧失胜诉权。
   • 专业咨询：如果案件复杂或涉及金额较大，务必咨询并委托专业律师代理，以确保诉讼顺利进行和权益有效维护。

综上所述，停运损失的赔偿在法律上有明确的依据和计算标准。如果您决定通过法律途径来维护自己的权益，请务必充分准备证据、明确诉讼请求和赔偿金额，并遵循法律程序进行诉讼。希望这些信息能对您有所帮助。