若加害人对司法鉴定结果有争议，可按以下步骤处理：

1. 提出书面异议
   加害人应在收到鉴定意见书后法定期限内（通常为15日）向委托鉴定的办案机关（如公安机关、检察院或法院）提交书面异议，明确指出鉴定程序违法、依据不足、结论错误等具体问题，并附相关证据材料。例如，若认为鉴定样本被污染，需提供样本采集、保存环节存在过错的证据。

2. 申请补充鉴定或重新鉴定
   根据《司法鉴定程序通则》第三十一条，若异议成立，办案机关可要求原鉴定机构补充鉴定（如补充材料、完善方法）或委托其他鉴定机构重新鉴定。重新鉴定需满足法定条件，如鉴定机构或人员不具备资质、程序严重违法、结论明显依据不足等。例如，若原鉴定机构未回避利益冲突，重新鉴定申请被支持的概率较高。

3. 申请鉴定人出庭或专家辅助人参与
   在诉讼阶段，加害人可依据《民事诉讼法》第八十二条或《刑事诉讼法》第一百九十七条，申请鉴定人出庭说明鉴定过程及依据。若鉴定涉及专业领域（如法医病理、痕迹鉴定），还可申请专家辅助人出庭对鉴定意见提出质疑，通过交叉询问揭示矛盾点。例如，在医疗纠纷中，可聘请临床专家对鉴定报告中的诊疗行为合理性提出异议。

4. 通过质证程序挑战鉴定效力
   在庭审中，加害人需围绕鉴定意见的合法性、关联性、真实性进行质证，重点攻击鉴定程序（如未通知当事人到场）、方法科学性（如采用已淘汰的技术标准）或结论逻辑性（如数据推导存在漏洞）。例如，若鉴定报告未附鉴定人资质证明，可主张其不具备法律效力。

5. 利用上诉或申诉程序救济
   若一审法院未采纳异议并采信鉴定意见，加害人可在上诉或申诉阶段继续主张鉴定违法，要求二审或再审法院委托重新鉴定。根据《刑事诉讼法》第二百五十六条，若原判决、裁定认定事实错误，可能因鉴定问题被撤销或改判。

注意事项：

• 争议处理需严格遵循时限，逾期可能丧失救济权利；
  
• 重新鉴定费用通常由提出申请方预交，最终由责任方承担；
  
• 若鉴定意见被推翻，原鉴定机构可能面临行政处罚或行业惩戒。
  

如有具体争议场景（如伤情鉴定、笔迹鉴定等），可进一步提供细节，我将结合实务经验分析策略。