交通肇事罪未被起诉，通常情况下不会留下案底，但具体还需根据不起诉的类型来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、案底的定义

案底，即犯罪记录，是指某人过去犯法或犯罪行为的记录，这些记录由法院在判决后形成，并伴随个人终身。在交通肇事罪的语境下，如果案件经过法院审判并判定有罪，那么就会留下案底。

二、交通肇事罪不起诉的类型与案底关系

1. 法定不起诉：

   • 情形：包括情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚；依照刑法告诉才处理的犯罪且没有告诉或撤回告诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡；其他法律规定免予追究刑事责任等。
   • 结果：不会留下案底。因为法定不起诉意味着行为本身不被认定为犯罪，案件未经法院审判，因此不会形成犯罪记录。

2. 酌定不起诉：

   • 情形：犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚。在交通肇事案件中，若肇事行为虽然构成犯罪但情节轻微，如肇事后果较轻、积极赔偿被害人并取得谅解、有自首立功等情节，检察院可能会酌定不起诉。
   • 结果：理论上会留有案底的风险，但实践中存在争议。从法律条文上看，酌定不起诉意味着行为在事实上构成了犯罪，只是由于情节轻微且检察院从刑事政策和司法效益等方面考虑作出不起诉决定。然而，在司法实践中，由于酌定不起诉并未经过法院审判，且行为情节轻微，因此通常不会留下正式的犯罪记录。但为了保险起见，可以认为存在极小的留下案底的风险，具体还需根据当地司法实践和政策来判断。不过，从普遍理解和实践操作来看，酌定不起诉通常不被视为有案底。

3. 证据不足不起诉：

   • 情形：因证据不足不符合起诉条件。在交通肇事案件中，若证据无法达到确实、充分的证明标准，无法认定犯罪嫌疑人的行为构成交通肇事罪，则检察院会存疑不起诉。
   • 结果：不会留下案底。由于证据不足不能认定犯罪嫌疑人有罪，按照疑罪从无的原则，不会留下犯罪记录。

三、不起诉后的法律后果与建议

• 法律后果：对于交通肇事罪的肇事者，即使人民检察院作出不起诉决定，其仍需对受害方承担民事赔偿责任，包括但不限于医疗费用、误工费以及可能的精神损害抚慰金等。
• 建议：
  1. 了解不起诉类型：如果收到检察院的不起诉决定书，务必了解清楚不起诉的具体类型，以便判断是否会留下案底。
  2. 咨询专业律师：虽然我已经给出了详细的解释，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你对不起诉决定或案底问题有进一步的疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律意见。
  3. 注意民事赔偿：无论是否留下案底，肇事者都需依法承担民事赔偿责任。因此，在处理交通肇事案件时，务必重视民事赔偿问题，积极与受害方沟通协商，争取达成和解协议。

综上所述，交通肇事罪未被起诉通常不会留下案底，但具体还需根据不起诉的类型来判断。如果你对此问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。