当实习单位在实习协议或相关文件上盖章使用的是合同章时，为了确保文件的正式性和有效性，同时避免未来可能出现的纠纷，建议在盖章时注明该合同章的使用目的和范围。具体来说，可以采取以下措施：

1. 明确标注用途：

   • 在盖章处附近或文件的相关条款中，明确标注“此合同章仅用于本次实习协议/相关文件的签署，不代表公司正式合同或长期合作协议的签署”。

2. 确认单位授权：

   • 确保盖章行为已经得到实习单位的正式授权，最好有书面授权文件或相关负责人的签字确认，以证明该合同章的使用是合法且有效的。

3. 保留盖章记录：

   • 保存好盖章的原件或复印件，以及盖章时的相关照片或视频记录（如果可能的话），以备未来需要时作为证据。

4. 学校或第三方鉴证：

   • 如果实习协议需要学校作为鉴证第三方进行盖章，那么在提交给学校之前，应确保实习单位已经按照上述要求进行了标注和确认。学校在审核时也会关注盖章的合法性和有效性。

5. 了解合同章的法律效力：

   • 合同章通常用于签署具有法律约束力的合同或协议。虽然实习协议可能不具有正式劳动合同的全部法律效力，但使用合同章仍然需要谨慎对待。确保双方都清楚该章的使用目的和范围，以避免未来可能出现的误解或纠纷。

6. 咨询法律专业人士：

   • 如果对实习单位使用合同章的具体法律效力或潜在风险有疑问，建议咨询法律专业人士或学校的相关部门（如法务部门或就业指导中心）以获取更准确的法律意见。

额外建议：

• 在签署实习协议之前，务必与实习单位详细沟通并确认所有条款和细节，包括实习期限、工作内容、薪酬待遇、保密义务等。
• 如果实习单位提出使用合同章进行签署，可以要求其提供正式的授权文件或相关负责人的签字确认，以确保盖章行为的合法性和有效性。
• 在签署后，及时将实习协议提交给学校进行鉴证和备案，以确保自己的权益得到保障。