结论：污水管道放在您购买的商业房内是否合法，需根据具体情况判断，包括管道设计是否符合规范、是否影响房屋正常使用、是否侵犯您的合法权益等。以下从多个角度为您详细分析：

1. 管道设计合规性：

   • 法律依据：根据《建筑给水排水设计标准》等相关规定，建筑物的污水管道设计应满足排水需求，同时确保管道布局合理，不影响建筑物的正常使用和安全。
   • 分析：若污水管道的设计符合相关建筑规范，且经过相关部门审批，那么从设计合规性角度来看，管道放在您屋内可能是合法的。但您仍有权要求开发商或物业提供管道设计的合规证明。

2. 房屋正常使用影响：

   • 法律依据：根据《民法典》中关于物权的规定，业主对其建筑物专有部分享有占有、使用、收益和处分的权利。若污水管道的存在严重影响了您对房屋的正常使用，如产生噪音、异味等，则可能构成对您物权的侵犯。
   • 分析：您需要评估污水管道是否对您的商业活动造成了实质性影响。如果影响显著，您有权要求开发商或物业采取措施进行整改，如隔音处理、定期清洁等，甚至要求调整管道位置。

3. 合同条款审查：

   • 法律依据：根据《民法典》中关于合同的规定，您与开发商签订的购房合同中应明确房屋的结构、设施等具体情况。若合同中未明确提及污水管道的位置，或明确约定管道不应位于您屋内，则开发商可能构成违约。
   • 分析：建议您仔细审查购房合同，特别是关于房屋结构和设施的描述部分。如果合同中有相关约定，且开发商违反了约定，您有权依据合同要求开发商承担违约责任，包括整改、赔偿等。

4. 侵权责任与救济途径：

   • 法律依据：若污水管道的存在确实侵犯了您的合法权益，如造成财产损失或人身伤害，您有权依据《民法典》中关于侵权责任的规定，要求侵权人（可能是开发商、物业或第三方）承担侵权责任。
   • 分析：在确认侵权事实后，您可以先与侵权人协商解决；协商不成的，可以向相关部门投诉或提起诉讼，要求侵权人停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

建议：

• 首先，与开发商或物业沟通，要求他们提供管道设计的合规证明，并解释管道为何会放在您屋内。
• 其次，仔细审查购房合同，看是否有关于管道位置的明确约定。
• 如果沟通无果或合同中有不利条款，建议您咨询专业律师（即我，饶振宇律师，专注于房产纠纷等领域），以便更详细地了解您的权益和可能的救济途径。
• 在必要时，您可以向相关部门（如住建部门、城管部门等）投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。