小区内有脚手架店铺是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若脚手架店铺是临时搭建，且经过相关部门审批：
- 在一些情况下，小区内可能因施工、维修等需要临时搭建脚手架，并在此基础之上设置临时店铺。如果这种搭建和店铺设置已经经过了城市规划、建设、消防等相关部门的审批，并且符合相关的安全、卫生、环保等标准，那么这种店铺是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，任何建设活动都需要经过规划部门的审批，确保符合城市规划和建设要求。同时，店铺的设置也需要符合消防、卫生等部门的规定，确保公共安全。
若脚手架店铺是未经审批擅自搭建：
- 如果小区内的脚手架店铺是未经相关部门审批擅自搭建的，那么这种店铺就是违法的。它可能违反了城市规划、建设、消防等多方面的法律法规，存在安全隐患，也可能对小区居民的正常生活造成影响。
- 法律后果：对于未经审批擅自搭建的店铺，相关部门有权责令其拆除，并可能处以罚款等行政处罚。如果因店铺搭建或运营导致他人损害的，搭建者还需要承担相应的民事赔偿责任。
若脚手架店铺虽经审批，但超出审批范围或期限：
- 即使脚手架店铺的搭建和设置最初经过了相关部门的审批，但如果在实际运营过程中超出了审批的范围（如面积、高度、用途等）或期限，那么这种超出部分也是违法的。
- 处理方式：对于超出审批范围或期限的店铺，相关部门同样有权责令其整改或拆除，并可能处以罚款等行政处罚。
建议：
- 对于小区居民来说，如果发现小区内有未经审批或超出审批范围、期限的脚手架店铺，可以向城市规划、建设、消防等相关部门举报，由相关部门依法处理。
- 对于店铺经营者来说，应该确保自己的店铺搭建和设置符合相关法律法规的要求，经过相关部门的审批，并严格按照审批的范围和期限进行运营。
总结：小区内有脚手架店铺是否合法，取决于其是否经过相关部门的审批，以及是否符合相关的安全、卫生、环保等标准。如果未经审批或超出审批范围、期限，那么这种店铺就是违法的。如果您对小区内的脚手架店铺有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。