收政府征地预借款的处理需根据借款性质、合同约定及法律规定综合判断，具体处理方式如下：

1. 明确预借款性质
   需首先确认该款项是否为“预付款”或“借款”。若为政府预支付的征地补偿款（即预付款），通常视为补偿款的一部分，后续需从正式补偿款中扣除；若为政府或相关部门以借款名义支付的款项（如临时周转资金），则需按借款合同约定履行还款义务。
   法律依据：根据《土地管理法》第四十八条，征地补偿费用包括土地补偿费、安置补助费等，预付款若属于补偿款范畴，则无需单独偿还；若为借款，则适用《民法典》合同编关于借款合同的规定。

2. 核查合同条款
   若预借款基于双方签订的书面协议（如《征地补偿预支协议》《借款合同》），需严格审查合同条款：

   • 还款条件：合同是否约定还款期限、利息及违约责任；
     
   • 资金用途：款项是否限定用于特定目的（如搬迁、安置）；
     
   • 抵扣条款：若为预付款，合同是否明确后续从正式补偿款中扣除。
     风险提示：若合同未明确约定或条款模糊，可能引发纠纷，需通过协商或诉讼明确权利义务。

3. 区分处理方式

   • 情形一：预付款（补偿款性质）
     无需偿还，但需保留收款凭证，并在最终补偿款结算时配合抵扣。若政府未足额支付补偿款，可依据《行政诉讼法》提起行政诉讼，要求补足差额。
     
   • 情形二：借款（需偿还）
     按合同约定还款，若政府存在违规出借（如未履行审批程序），可主张合同无效或部分无效，但需提供证据（如政府内部文件、审批流程瑕疵等）。
     
   • 情形三：无合同或合同无效
     若款项性质无法明确且无书面协议，需通过协商、行政复议或诉讼解决。此时需重点收集证据（如转账记录、政府文件、沟通记录等），证明款项实际用途及双方真实意思表示。

4. 合规风险防范

   • 政府方：需确保预借款行为符合《预算法》《政府投资条例》等规定，避免违规出借财政资金；
     
   • 个人/企业方：若为借款，需按约定用途使用资金，避免挪作他用导致违约；若为预付款，需保留相关凭证，防止政府以“借款”名义追偿。

建议行动步骤：

1. 整理所有与预借款相关的文件（合同、转账记录、政府通知等）；
   
2. 咨询专业律师分析款项性质及合同效力；
   
3. 根据律师意见与政府协商或通过法律途径解决争议。
   

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