针对您提出的“机动车在人行道上已停车让行还扣分怎么处理”的问题，首先需要明确的是，如果机动车确实已经按照规定在人行道上停车让行了行人，那么正常情况下是不应该被扣分的。不过，既然您提到了扣分的情况，我们可以从几个方面来分析和解答：
一、核实扣分原因
确认是否真的已停车让行：
- 有时候，驾驶人可能认为自己已经停车让行了，但实际上可能并未完全满足法规要求，比如停车位置不当、未完全停止等。
- 建议回顾当时的行车记录或监控录像，确认是否真的已经按照规定停车让行。
检查是否有其他违法行为：
- 除了未停车让行外，还可能存在其他违法行为，如超速、逆行、未按规定使用灯光等，这些也可能导致扣分。
- 仔细查看扣分通知单上的具体违法行为描述，确认是否有其他违规行为。
二、处理扣分情况
接受处罚并缴纳罚款：
- 如果确认存在违法行为并被扣分，那么需要按照扣分通知单上的要求，在规定时间内到指定地点接受处罚并缴纳罚款。
- 逾期不缴纳罚款的，可能会面临额外的滞纳金或其他法律后果。
申请复核或申诉：
- 如果认为扣分存在误判或不合理情况，可以向当地交通管理部门申请复核或申诉。
- 申诉时需要提供相关证据，如行车记录、监控录像等，以证明自己的清白或减轻处罚。
三、预防未来扣分
加强交通法规学习：
- 深入了解并遵守《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规，特别是关于人行道停车让行的规定。
- 定期参加交通安全教育学习，提高自己的交通安全意识。
注意行车细节：
- 在行经人行横道时，提前减速并观察行人动态，确保安全后再通过。
- 停车让行时，确保车辆完全停止且不妨碍行人通行。
使用行车记录仪：
- 安装并使用行车记录仪，记录行车过程中的情况，以便在需要时提供证据。
四、特殊地区规定
- 需要注意的是，不同地区对于人行道停车让行的处罚标准可能存在差异。例如，深圳和上海等地区就有更为严格的处罚规定。
- 因此，在驾驶过程中，除了遵守国家统一法规外，还需要了解并遵守当地的特殊规定。
总结
如果机动车确实已经按照规定在人行道上停车让行了行人，但仍然被扣分，那么建议首先核实扣分原因，确认是否存在其他违法行为或误判情况。如果确认存在误判或不合理扣分，可以向当地交通管理部门申请复核或申诉。同时，为了预防未来扣分，建议加强交通法规学习、注意行车细节并使用行车记录仪记录行车情况。