在林地注册公司本身并不直接构成违法行为，但关键在于注册公司后的具体行为是否合法，特别是是否涉及非法占用或改变林地的用途。
首先，我们要明确的是，林地作为重要的生态资源，其用途受到国家法律的严格保护。任何改变林地用途的行为，比如将林地转为建设用地进行商业开发或建设，都必须依法履行报批手续，获得相关主管部门的批准。
从您提供的参考信息中，我们可以看到一个具体的案例：陈某在未经报批的情况下，擅自在承租的林地上建设办公房、电机房及养殖池等，并登记注册了公司用于经营该养殖场。这一行为最终被法院认定为非法占用农用地罪，因为陈某违反了土地管理法规，未经主管部门批准非法占用了林地，并改变了其用途，造成了林地的严重毁坏。
这个案例清晰地表明，在林地注册公司本身不是问题，问题在于注册后的行为是否合法。如果您计划在林地注册公司，并希望进行合法的经营活动，那么您必须确保：
了解土地性质：在注册公司前，务必了解清楚所承租或使用的土地性质，确保其并非受法律保护的林地，或者即使属于林地，也已获得相关主管部门的批准用于您的经营活动。
履行报批手续：如果您的经营活动确实需要改变林地的用途，那么必须依法向相关主管部门提出申请，并履行报批手续。未经批准，不得擅自改变林地用途。
遵守法律法规：在经营过程中，务必遵守国家和地方有关森林资源保护管理的法律、法规、规章和制度，确保您的经营活动不会对林地造成破坏或污染。
综上所述，在林地注册公司本身并不违法，但必须确保注册后的行为合法合规，特别是要遵守关于林地保护和使用的相关法律法规。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，建议咨询当地的林业主管部门或法律专业人士。