在等待区（如路口的停止线内或待行区）等待时，若信号灯由绿灯变为红灯后车辆继续通行，通常会被认定为“闯红灯”行为，处罚标准为：罚款200元，驾驶证记6分。以下是具体分析：

1. 法律认定依据
   根据《道路交通安全法实施条例》第三十八条，红灯亮时禁止车辆通行。若车辆在等待区（如停止线前）已停车等待，但信号灯变红后仍越过停止线继续行驶，即构成“闯红灯”行为。
   例外情形：若车辆在变灯瞬间已整体越过停止线（即前轮和后轮均已过线），此时继续通行通常不被认定为闯红灯，但需确保安全。

2. 处罚的合理性说明

   • 罚款200元：依据《道路交通安全法》第九十条，对闯红灯行为可处200元罚款。
     
   • 记6分：根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，闯红灯一次记6分，旨在通过扣分机制强化驾驶人对信号灯的遵守。

3. 特殊场景的补充说明

   • 黄灯过渡期：若车辆在黄灯亮起时已越过停止线，可继续通行；但若黄灯期间未越线却强行通过，可能被认定为闯红灯。
     
   • 交警指挥与信号灯冲突：若现场有交警指挥，应优先服从交警手势，此时即使闯红灯也不予处罚。
     
   • 避让特殊车辆：如因避让执行任务的救护车、消防车等特殊车辆而闯红灯，可申请复议撤销处罚。

建议：驾驶时需提前观察信号灯变化，在等待区停车时保持与停止线的安全距离，避免因变灯后误操作导致违法。若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有其他交通法律问题，欢迎直接向我咨询。