结论前置：员工因不能胜任工作被辞退时，是否有赔偿取决于多种因素，包括是否处于试用期、用人单位是否履行了法定程序（如提供培训或调整岗位）、以及解除劳动合同的程序是否合法等。

一、试用期内的解除

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第一项，若员工在试用期内被证明不符合录用条件（如不能胜任工作且经过培训或调整工作岗位仍不能胜任），用人单位可以辞退劳动者而无需支付经济补偿金。

2. 实际操作：在此情况下，用人单位需有充分证据证明员工在试用期内确实不能胜任工作，且已履行了培训或调整岗位等法定程序。若证据不足或程序不合法，则可能构成违法解除劳动合同。

二、试用期外的解除

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第二项，员工过了试用期后，若不能胜任工作，且经过培训或者调整工作岗位仍不能胜任，用人单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同。同时，根据该法第四十六条规定，用人单位在此种情况下解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。

2. 经济补偿计算：

   • 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；
   • 六个月以上不满一年的，按一年计算；
   • 不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
   • 这里的月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

3. 实际操作：用人单位需确保已履行了培训或调整岗位等法定程序，并提前三十日以书面形式通知劳动者或额外支付一个月工资。若未履行这些程序，则可能构成违法解除劳动合同，需支付赔偿金。

三、违法解除与赔偿金

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，若用人单位无法证明劳动者不能胜任工作，或者未对不能胜任工作的劳动者进行培训或调整工作岗位，就直接以不能胜任工作为由辞退员工，这构成违法解除劳动合同。用人单位应依照该法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

2. 赔偿金计算：

   • 赔偿金计算基于员工在本单位工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准；
   • 六个月以上不满一年的，按一年计算；
   • 不满六个月的，支付一个月工资的赔偿金。
   • 这里的月工资同样指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

四、特殊情况下的责任

• 若劳动者不能胜任工作是由于用人单位未提供适当的培训或劳动条件造成的，用人单位在解除劳动合同时可能需要承担更大的责任，包括但不限于支付额外的经济补偿或赔偿金。

五、实际案例分析

• 假设员工小张在某公司工作了2年零8个月，月平均工资为7000元。若公司以小张不能胜任工作且经过培训后仍不能胜任为由合法解除劳动合同，则需向小张支付3个月工资的经济补偿，即21000元。若公司未提前三十日书面通知，还需额外支付一个月工资7000元。
• 若公司无任何证据证明小张不能胜任工作就直接将其辞退，则属于违法解除劳动合同，应向小张支付赔偿金。赔偿金将为经济补偿（3×7000=21000元）的二倍，即42000元。

总结与建议：员工因不能胜任工作被辞退时的赔偿问题需根据具体情况判断。建议用人单位在做出辞退决定前，确保已履行了法定程序并保留了充分证据。同时，劳动者在面临此类情况时，也应了解自己的权益并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。