针对您提出的“孕妇年终绩效C是否合法”的问题，这主要取决于公司具体的绩效考核制度以及其执行方式是否符合相关法律法规。

首先，我们要明确的是，根据《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，女职工在产假期间应享受与在职期间相同的工资待遇，这包括绩效工资。公司不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动或聘用合同。这是保护女职工权益的基本法律原则。

接下来，我们分析绩效考核的情况。虽然法律并未明确规定产假期间是否需要参加年度考核，但公司制定的绩效考核标准应当公平、合理，且不得对休产假的女职工产生不利影响。如果公司以女职工休产假为由，将其绩效评定为较低等级（如C级），并因此影响其年终奖或后续的绩效考核，这种做法可能涉嫌违法。

在实际操作中，一些公司可能会将绩效考核与出勤天数挂钩。然而，对于休产假的女职工，公司应将其视为正常出勤，在绩效考核时给予相应的考虑和调整，以确保其权益不受损害。如果公司未这样做，而是直接扣减了女职工的绩效工资或影响了其考核结果，女职工有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

以您提到的案例为例，如果公司因为女职工休产假而将其年终绩效评定为C级，且这种评定直接影响了女职工的年终奖或后续的绩效考核，那么这种做法很可能是不合法的。女职工可以依据相关法律法规，向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司纠正违法行为并补发被克扣的工资或奖金。

综上所述，孕妇年终绩效被评定为C级是否合法，取决于公司具体的绩效考核制度以及其执行方式是否符合相关法律法规。如果公司因此损害了女职工的合法权益，女职工有权采取法律手段来维护自己的权益。建议您在遇到类似情况时，及时咨询专业律师或劳动行政部门，以获取更具体的法律建议和帮助。