结论：是否需要退还已支付的40万，取决于多个因素，包括双方是否达成有效的和解协议、该协议是否合法合规、以及是否存在其他法定或约定的退款情形等。以下从不同角度为你详细分析：
一、和解协议的效力
有效和解协议：如果双方已经就诈骗案件达成了和解协议，并且该协议是在平等、自愿、合法的基础上签订的，那么该协议通常具有法律效力。在这种情况下，你已经按照协议支付了40万作为赔偿或和解金，且没有违反协议中的任何条款，那么通常不需要再退还这笔钱。
无效或可撤销的和解协议：如果和解协议存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，或者协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。在这种情况下，如果你已经支付了40万，但协议被撤销或确认无效，那么根据法律规定，你可能需要退还这笔钱，或者根据双方的过错程度分担损失。
二、刑事案件的进展
刑事和解与退赔：在金融诈骗案件中，如果犯罪嫌疑人或被告人愿意退赔被害人损失，并取得被害人的谅解，这通常可以作为量刑时的从轻或减轻情节。然而，这并不意味着你已经支付的40万必须退还。是否退还，还需要考虑上述和解协议的效力以及双方的具体约定。
刑事追缴与退赔程序：如果案件已经进入刑事追缴或退赔程序，法院可能会根据案件的具体情况，判决犯罪嫌疑人或被告人退赔被害人损失。在这种情况下，如果你已经支付的40万被认定为退赔款的一部分，且没有超出你应承担的退赔责任，那么通常不需要再退还。但如果法院判决你退赔的金额少于你已经支付的金额，那么多出的部分可能需要通过其他途径解决，如与被害人协商退还或作为其他债务的抵销等。
三、其他法定或约定的退款情形
法定退款情形：根据相关法律法规的规定，如果存在某些特定情形（如被害人因诈骗行为遭受重大损失且生活困难等），法院可能会判决你退还部分或全部已支付的款项。然而，这种情况通常比较罕见，且需要满足严格的法定条件。
约定退款情形：如果双方在和解协议中明确约定了退款的条件或情形（如犯罪嫌疑人或被告人未履行其他义务等），那么当这些条件或情形出现时，你可能需要按照协议约定退还已支付的款项。
建议
审查和解协议：首先，你需要仔细审查与被害人签订的和解协议，确认协议的效力以及双方的具体约定。如果协议存在疑问或不明确之处，建议咨询专业律师进行解读。
了解刑事案件进展：其次，你需要了解案件的刑事进展情况，包括是否已经进入刑事追缴或退赔程序等。这有助于你更好地判断自己是否需要退还已支付的款项。
与被害人协商：如果双方对退款问题存在争议或分歧，建议与被害人进行协商沟通，寻求双方都能接受的解决方案。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决争议。
咨询专业律师：由于金融诈骗案件涉及复杂的法律问题和刑事程序，建议你咨询专业律师以获取更具体、更专业的法律建议。我可以根据你的具体情况和案件进展，为你提供针对性的法律指导和帮助。
总之，是否需要退还已支付的40万取决于多个因素的综合考量。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。