在二级轻伤案件中，即使已经进行了赔偿，仍可能需要走以下程序：
刑事和解与撤案程序（如涉及刑事案件）：
- 刑事和解：若案件涉及刑事犯罪（如故意伤害罪），在赔偿后，双方可以达成刑事和解。刑事和解是犯罪嫌疑人、被告人以真诚悔罪、向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，双方自愿达成和解的，公安机关、人民检察院、人民法院应当听取当事人和其他有关人员的意见，对和解的自愿性、合法性进行审查，并主持制作和解协议书。
- 撤案或不起诉：达成刑事和解后，对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，人民检察院可以作出不起诉的决定。公安机关也可以根据具体情况，撤销案件。但需注意，这并非绝对，具体还需根据案件情况和法律规定来判断。
民事诉讼程序（如未通过刑事附带民事诉讼解决或需进一步主张权利）：
- 提起民事诉讼：即使已经进行了赔偿，如果被害人认为赔偿金额不足或存在其他民事权益受损的情况，仍然可以向人民法院提起民事诉讼，要求侵权人承担民事责任，包括赔偿损失、赔礼道歉等。
- 诉讼过程：在民事诉讼过程中，法院将依法审理案件，根据双方提供的证据和法律规定，作出判决或裁定。如果侵权人拒不履行判决或裁定，被害人可以申请强制执行。
行政处罚程序（如涉及违反治安管理行为）：
- 行政处罚：如果案件涉及违反治安管理行为（如殴打他人），即使已经进行了赔偿，公安机关仍可能根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定，对侵权人进行行政处罚，如罚款、拘留等。
- 处罚与赔偿并行：行政处罚与民事赔偿是两个独立的法律程序，行政处罚的作出并不影响民事赔偿的履行，反之亦然。
后续跟进与执行程序：
- 跟进案件进展：无论案件是否涉及刑事、民事或行政程序，都应跟进案件的进展情况，确保自己的权益得到充分保障。
- 执行程序：如果法院作出了判决或裁定，且侵权人拒不履行，被害人可以申请强制执行，通过法院强制侵权人履行义务。
建议：
- 在处理此类案件时，建议及时咨询专业律师，了解具体案件情况和法律规定，以便更好地维护自己的权益。
- 保留好所有相关证据和文件，如赔偿协议、医疗记录、证人证言等，以备不时之需。
- 积极配合公安机关、人民检察院和人民法院的工作，如实陈述事实，提供证据，以便案件得到公正、及时的处理。
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