结论前置：即使您因旷工三天被视为自动离职，您仍有权获得实际工作期间的工资。不过，具体支付情况还需根据公司的规章制度以及是否给公司造成了经济损失来综合判断。
一、工资支付的基本原则
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论您因何种原因离职，包括旷工三天自离，公司都应当支付您实际工作期间的工资。
二、实际工资的计算与支付
实际出勤天数：公司应当按照您实际出勤的天数和双方约定的工资标准来计算应支付的工资。例如，如果您的月工资为6000元，按每月21.75天的计薪天数计算，日工资约为275.86元。若您在自离前实际出勤了10天，则公司应支付您约2758.6元的工资。
工资支付方式：公司应当以货币形式按月支付工资给您本人，不得以实物或有价证券等形式替代货币支付。
三、旷工期间的工资扣除
公司规章制度：如果公司的规章制度中明确规定了旷工的处罚措施，如旷工一天扣除一定比例的工资等，且这些规定在合法范围内，那么公司可以按照这些规定扣除您旷工期间的工资。但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
扣除比例限制：即使公司因您的旷工行为造成了经济损失，并要求您赔偿，每月扣除的部分也不得超过您当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
四、经济损失的赔偿
赔偿条件：如果您的旷工行为确实给公司造成了直接的经济损失，公司可以要求您进行赔偿。但赔偿金额需根据实际情况具体评估，并确保合理性。
赔偿与工资支付的关系：赔偿与工资支付是两个独立的问题。公司不能因您造成损失而完全拒绝支付您应得的工资。公司可以在支付工资时扣除相关损失，但需遵循上述扣除比例的限制。
五、特殊情况下的处理
未办理离职手续：如果您自离后未办理离职手续，公司可以暂时暂扣工资，但需及时通知您办理，并在合理期限内支付工资。
违反竞业限制或保密协议：如果您违反了竞业限制或保密协议，公司可以要求您赔偿损失。但同样需遵循扣除比例的限制，并确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
六、建议与行动
与公司协商：首先，您可以尝试与公司进行友好协商，明确表明您虽然存在旷工自离的情况，但依法仍有权获得已工作天数的劳动报酬。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门进行投诉。投诉时需准备好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明您在公司的工作情况以及旷工的具体情况。
申请劳动仲裁：如果劳动监察部门无法解决问题，您可以申请劳动仲裁。在申请前需准备好证明劳动关系存在、工作时间和工作量等材料，并撰写劳动仲裁申请书，明确写明自己的基本信息、用人单位的基本信息、仲裁请求（即要求用人单位支付拖欠的工资）、事实和理由等内容。
提起诉讼：如果对劳动仲裁的结果不满意，您可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要遵循民事诉讼的程序和规则，向法院提交起诉状、证据等材料，并参加庭审。
最后，我希望您能理解，虽然旷工自离可能违反了公司的规章制度，但这并不影响您获得实际工作期间的工资。如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，请随时向我咨询，我会尽力为您提供帮助。