结论：在老公作为公司法人因运输费用未支付而被起诉的情况下，是否会查封夫妻共同房产，取决于多个因素，包括债务性质、房产登记情况以及法院的具体执行措施等。以下是对这一问题的详细分析：
一、债务性质的影响
个人债务与共同债务：
- 如果该运输费用债务被认定为老公的个人债务（例如，债务是他在公司经营过程中以个人名义所借，且未用于家庭共同生活或生产经营），那么一般情况下，法院不会直接查封夫妻共同房产来偿还个人债务。
- 如果该债务被认定为夫妻共同债务（例如，债务是用于家庭共同生活或生产经营，或者夫妻双方共同签字确认），那么法院在执行时可能会考虑查封夫妻共同房产。
公司债务与个人责任：
- 作为公司法人，老公对公司债务通常承担有限责任。但如果他存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，那么他可能需要对公司债务承担连带责任。在这种情况下，如果债务被认定为需要老公个人承担，且该债务与家庭共同生活或生产经营有关，法院可能会考虑查封夫妻共同房产。
二、房产登记情况的影响
房产登记在老公个人名下：
- 如果房产登记在老公个人名下，且债务被认定为他的个人债务，那么法院在执行时可能会直接查封该房产。
- 如果房产虽然登记在老公个人名下，但实际上是夫妻共同财产（例如，婚后购买且双方有共同出资或还贷），且债务被认定为夫妻共同债务，那么法院在执行时也可能会查封该房产。
房产登记在夫妻双方名下：
- 如果房产登记在夫妻双方名下，无论债务是个人债务还是共同债务，法院在执行时都可能会考虑查封该房产。因为登记在双方名下的房产通常被视为夫妻共同财产。
三、法院执行措施的影响
执行程序：
- 法院在执行过程中，会遵循一定的法律程序。在查封房产前，法院通常会先发出执行通知书，要求被执行人履行义务。如果被执行人未履行义务，法院才会考虑采取查封、拍卖等强制执行措施。
执行异议：
- 如果夫妻一方认为法院查封房产的行为侵犯了其合法权益（例如，认为该房产是其个人财产而非共同财产），可以向法院提出执行异议。法院会依法审查并作出裁决。
四、建议与措施
了解债务性质：
- 首先，需要了解该运输费用债务的具体性质，是个人债务还是共同债务，以及是否与公司经营有关。这有助于判断法院是否会查封夫妻共同房产。
保留相关证据：
- 保留与房产购买、出资、还贷等相关的证据，以证明房产的归属情况。这有助于在法院执行时提出异议或进行辩护。
咨询专业律师：
- 在面对此类法律问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况分析债务性质、房产归属以及法院执行措施等因素，为你提供有针对性的法律策略。
积极应对诉讼：
- 如果已经被起诉，应积极应对诉讼，配合法院的调查和执行工作。同时，也可以考虑与债权人协商和解或制定还款计划等，以减轻执行压力。
最后，是否会查封夫妻共同房产取决于多个因素的综合考量。如果你或你的家人面临此类问题，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。