司法鉴定基础收费2万元是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、司法鉴定收费的一般原则
司法鉴定收费通常遵循政府指导价与市场调节价相结合的原则。对于依法实行政府指导价管理的司法鉴定服务，其收费标准由省级价格主管部门会同同级司法行政部门制定，并报经省级人民政府批准后公布执行。而对于依法实行市场调节价管理的司法鉴定服务，则由司法鉴定机构与委托人协商确定收费标准。
二、基础收费2万元的合法性分析
若该司法鉴定服务属于政府指导价管理范围：
- 你需要查阅当地省级价格主管部门和司法行政部门联合发布的司法鉴定收费标准，确认该类鉴定服务的基础收费是否包含2万元这一档次。
- 如果收费标准中明确规定了该类鉴定服务的基础收费上限低于2万元，那么司法鉴定机构收取2万元基础费用则可能构成违法收费。
- 如果收费标准中未明确规定基础收费的具体数额，或者规定了较高的收费上限，且2万元在该上限范围内，则司法鉴定机构收取2万元基础费用可能是合法的。
若该司法鉴定服务属于市场调节价管理范围：
- 司法鉴定机构与委托人可以协商确定收费标准，包括基础收费。
- 在这种情况下，只要双方协商一致，且没有违反法律法规的强制性规定（如不得利用优势地位强制收费、不得收取不合理费用等），那么司法鉴定机构收取2万元基础费用就是合法的。
三、建议与注意事项
- 核实收费标准：在委托司法鉴定前，建议你先了解当地司法鉴定服务的收费标准，特别是政府指导价管理的部分，以便对收费情况有一个大致的预期。
- 签订书面合同：与司法鉴定机构签订书面合同，明确约定鉴定服务的内容、收费标准、支付方式等条款，以避免后续产生纠纷。
- 保留相关证据：在支付费用时，要求司法鉴定机构出具正规的发票或收据，并保留好相关证据，以备不时之需。
- 咨询与投诉：如果你对司法鉴定机构的收费有疑问或不满，可以先向该机构咨询或提出异议。如果无法得到满意的答复，你可以向当地司法行政部门或价格主管部门投诉。
如果你对司法鉴定收费有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。