结论：顶包后自首且顶包者又如实供述的情况下，是否会吊销驾驶证需根据具体案情及交通肇事中的责任情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、顶包行为本身的法律性质
顶包行为，即替他人承担责任或罪名的行为，在法律上通常被视为妨碍司法公正的行为。如果顶包行为涉及交通肇事案件，且顶包者明知他人有交通肇事行为而为其顶包，那么顶包者可能构成包庇罪。然而，就驾驶证吊销问题而言，它主要关注的是交通肇事行为本身及其后果，而非顶包行为本身。
二、交通肇事与驾驶证吊销的关系
交通肇事构成犯罪的情况：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零一条：“违反道路交通安全法律、法规的规定，发生重大交通事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。”
- 如果顶包者所顶包的交通肇事行为构成犯罪（如交通肇事罪），且该行为与驾驶证的持有和使用直接相关，那么在追究刑事责任的同时，驾驶证很可能会被吊销。
交通肇事未构成犯罪的情况：
- 如果交通肇事行为未构成犯罪，但造成了财产损失或人身伤害，且顶包者作为实际驾驶人或相关责任人，其驾驶证的吊销将取决于具体的交通违法情况和地方交通管理部门的处罚规定。
- 在这种情况下，即使顶包者自首并如实供述，也不能完全排除驾驶证被吊销的可能性，因为吊销驾驶证的决定通常基于交通违法行为的严重性和后果。
三、自首与如实供述的影响
自首：
- 自首是犯罪嫌疑人或被告人在犯罪后自动投案，并如实供述自己罪行的行为。根据《中华人民共和国刑法》第六十七条：“犯罪以后自动投案，如实供述自己的罪行的，是自首。对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。”
- 自首通常会对犯罪嫌疑人或被告人的量刑产生积极影响，但它并不直接影响驾驶证的吊销决定。驾驶证的吊销主要基于交通违法行为的性质和后果。
如实供述：
- 如实供述是犯罪嫌疑人或被告人在接受调查时如实陈述自己罪行的行为。它有助于司法机关查明事实真相，但同样不影响驾驶证的吊销决定。
四、具体案情的影响
- 最终是否吊销驾驶证还取决于具体的案情，包括交通肇事行为的严重性、后果、顶包者的角色和责任、以及地方交通管理部门的处罚规定等。
- 如果顶包者并非实际驾驶人，或者其顶包行为与交通肇事行为无直接关联，那么其驾驶证可能不会被吊销。
建议：
- 如果您或他人涉及此类情况，建议尽快咨询专业律师，以便更准确地了解法律后果和可能的辩护策略。
- 在处理此类案件时，应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实真相，以争取从轻或减轻处罚的机会。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。