协议当然可以写在纸上，这是最常见且合法有效的协议形式之一。以下从多个角度为你详细分析：

1. 法律认可性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。因此，将协议写在纸上，即属于书面形式的一种，是受到法律认可和保护的。

2. 证据效力：

   • 纸质协议作为书面证据，在发生纠纷时，其证明力通常较强。因为纸质协议可以直观地展示双方当事人的意思表示，且不易被篡改或伪造（当然，这并不意味着纸质协议绝对安全，仍需注意保管和防伪措施）。相比之下，口头协议在举证时往往面临更大的困难。

3. 实际应用中的注意事项：

   • 内容完整性：确保协议内容完整、明确，包括双方当事人的信息、协议的目的、条款、权利义务、违约责任等关键要素。
   • 签字盖章：协议应由双方当事人签字或盖章，以表明双方对协议内容的认可和接受。如果是公司之间签订协议，还需要加盖公司公章或合同专用章。
   • 保管妥善：签订好的纸质协议应妥善保管，避免丢失或损坏。在可能的情况下，可以制作多份副本，分别由双方当事人保管。

4. 其他形式协议的补充说明：

   • 除了纸质协议外，当事人还可以选择电子协议等其他形式。电子协议同样具有法律效力，但需要注意其符合电子签名法等相关法律法规的要求，以确保其合法性和有效性。不过，在大多数日常交易和商务合作中，纸质协议仍然因其直观性和易保管性而备受青睐。

总结与建议：

• 协议写在纸上是完全合法且有效的，也是实际应用中最常见的形式。
• 在签订纸质协议时，务必注意内容的完整性、签字盖章的真实性以及保管的妥善性。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。