在摩托车与小车发生车祸后车辆被拖走，维修费的计算主要涉及责任认定、保险理赔以及可能的自费部分这几个关键环节，以下是详细说明：

1. 责任认定是基础：首先需要明确事故责任方，这通常由交警部门根据现场勘查、证人证言、监控录像等证据，出具《交通事故责任认定书》来确定。如果一方被认定为全责，那么该方需承担双方车辆的维修费用；若双方都有责任，则按责任比例分担维修费用。例如，若摩托车方负30%责任，小车方负70%责任，那么维修费用也将按此比例分担。

2. 保险理赔是关键：在责任明确后，接下来要看双方是否购买了车辆保险，特别是交强险和商业第三者责任险。交强险是法定必须购买的，它能在一定限额内赔偿对方的人身伤亡和财产损失。而商业第三者责任险则是自愿购买的，可以提供更高额度的赔偿。如果责任方购买了足够的保险，那么维修费用大部分甚至全部可以由保险公司承担。但需要注意的是，保险公司可能会根据保险条款对某些维修项目或费用进行核减或拒赔。

3. 维修费用的具体计算：维修费用通常包括零部件更换费用、工时费以及其他可能的费用（如拖车费、停车费等）。在计算时，需要提供正规的维修发票和维修清单作为依据。如果双方对维修费用有争议，可以共同委托第三方机构进行评估或鉴定。

4. 自费部分的处理：如果维修费用超出了保险赔偿限额，或者某些费用不在保险赔偿范围内（如非医保用药、自费项目等），那么这部分费用就需要由责任方自行承担。

举例说明：假设摩托车与小车相撞，小车被认定为全责，且小车购买了交强险和商业第三者责任险。摩托车维修费用共计5000元，其中4000元在保险赔偿范围内，1000元为非医保用药费用。那么，保险公司将赔偿4000元，剩余的1000元需由小车车主自行承担。

建议：在处理此类事故时，建议双方保持冷静，及时报警并保护好现场。同时，尽快联系保险公司并保留好相关证据（如现场照片、维修发票等），以便后续理赔。如果对责任认定或维修费用有争议，可以寻求法律援助或咨询专业律师。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。