您好，关于您提出的“儿童在没有监护人的陪同下，商店对儿童打耳洞是否违法”的问题，这主要涉及到未成年人保护以及相关商业行为规范的问题。

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国未成年人保护法》的相关规定，未成年人的身心健康和合法权益是受到法律严格保护的。对于涉及未成年人的商业行为，特别是那些可能对未成年人身体造成伤害的行为，法律通常会有更为严格的规定和限制。

针对您提到的“商店对儿童打耳洞”这一行为，虽然直接的法律规定可能并未明确提及“打耳洞”这一具体行为，但我们可以从相关法律原则和精神出发进行分析。打耳洞，作为一种对身体的轻微创伤性操作，对于未成年人来说，可能存在一定的健康风险。特别是在没有监护人陪同的情况下，儿童可能无法充分理解这一行为的后果，也无法有效保护自己的权益。

进一步地，如果商店在未经监护人同意的情况下，擅自为儿童提供打耳洞服务，这很可能构成对未成年人权益的侵害。此外，如果商店在提供此类服务时，未遵循相关的卫生和安全标准，还可能对儿童的健康造成更大的威胁。

虽然直接的法律条文可能并未明确规定此类行为的违法性，但根据法律对未成年人保护的原则和精神，以及商业行为应遵循的伦理和规范，我们可以合理推断，商店在没有监护人陪同的情况下为儿童打耳洞，很可能构成违法行为，至少是不符合商业道德和未成年人保护原则的行为。

因此，我建议您，如果遇到此类情况，应及时向相关部门（如市场监管部门、消费者协会等）进行投诉和举报，以维护未成年人的合法权益和身体健康。同时，也希望商家能够自觉遵守相关法律法规和商业道德，不要为未成年人提供可能对其健康造成伤害的服务。