遭遇家庭暴力，包括被亲生父亲殴打，你可以通过以下法律程序来维护自己的合法权益：
及时报警并保留证据：
- 遭遇家庭暴力后，应第一时间拨打110报警，让警方及时出警处理。警方到场后，会详细记录事件经过，并可能对施暴者进行训诫、警告或采取其他强制措施。
- 同时，要尽可能保留好相关证据，如现场照片、视频、医疗记录、警方出具的报警回执或受案回执等。这些证据在后续的法律程序中至关重要。
向公安机关申请伤情鉴定：
- 如果受伤较为严重，可以向公安机关申请伤情鉴定。伤情鉴定结果将作为认定家庭暴力事实的重要依据，也是后续可能涉及的刑事诉讼或民事赔偿的关键证据。
考虑向法院申请人身安全保护令：
- 如果担心再次受到家庭暴力的威胁，可以向居住地或家庭暴力发生地的基层人民法院申请人身安全保护令。法院会根据申请人的情况，作出禁止施暴者实施家庭暴力、骚扰、跟踪、接触申请人及其相关近亲属等措施的裁定。
提起民事诉讼要求赔偿：
- 如果因家庭暴力导致身体受伤或财产损失，可以向法院提起民事诉讼，要求施暴者承担民事赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明家庭暴力的存在以及因此造成的损失。
考虑刑事自诉（如构成犯罪）：
- 如果家庭暴力行为构成犯罪（如故意伤害罪、虐待罪等），且公安机关不予立案或检察机关不予起诉的，受害人可以向法院提起刑事自诉，要求追究施暴者的刑事责任。
在处理此类问题时，还需注意以下几点：
- 保持冷静与理智：在遭遇家庭暴力时，保持冷静与理智至关重要。不要与施暴者发生正面冲突，以免加重伤害。
- 寻求社会支持：可以向亲朋好友、社区组织或妇女保护机构等寻求帮助和支持。他们可以提供情感上的安慰、实际上的帮助以及法律上的指导。
- 了解相关法律法规：熟悉《中华人民共和国反家庭暴力法》、《中华人民共和国民法典》以及《中华人民共和国刑法》中关于家庭暴力的相关规定，有助于更好地维护自己的合法权益。
最后，请记住，家庭暴力不是家务事，而是违法行为。你有权保护自己免受家庭暴力的侵害，并可以通过法律程序来追究施暴者的责任。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。