亲子鉴定的准确性与孩子是否患有自闭症无关，只要鉴定流程规范、样本可靠，鉴定结果就是准确的。以下是详细分析：

1. 亲子鉴定的科学原理
   亲子鉴定是通过比对DNA序列的相似性来确定亲子关系，其核心依据是遗传学规律。自闭症是一种神经发育障碍，属于心理或行为层面的疾病，与DNA的物理结构或遗传标记的检测无关。因此，孩子的健康状况（包括自闭症）不会影响DNA样本的提取、比对或分析过程。

2. 鉴定准确性的关键因素

   • 样本质量：若提供的样本（如血液、口腔拭子、毛发等）未被污染或降解，且包含足够的DNA信息，鉴定结果通常准确率极高（可达99.99%以上）。
     
   • 实验室资质：选择具有司法鉴定资质的正规机构，确保其技术标准、设备精度和操作流程符合法律要求。
     
   • 鉴定方法：目前主流的STR分型技术或SNP分型技术均经过严格验证，结果具有高度可靠性。

3. 自闭症可能引发的间接问题
   若孩子因自闭症存在沟通障碍或行为异常（如抗拒采样），可能导致采样过程受阻，但只要最终获取的样本符合检测要求，仍不影响结果准确性。此外，若家长因孩子患病对亲子关系产生疑虑，需注意：

   • 亲子鉴定结果仅能解答生物学上的血缘关系，无法解决情感或伦理层面的困惑；
     
   • 若涉及抚养权、继承权等法律纠纷，鉴定报告可作为证据使用，但需结合其他证据综合认定。

建议：若您需要为孩子做亲子鉴定，请优先选择正规机构，并确保采样过程规范。如有法律程序需求（如上户口、诉讼等），可提前向我咨询鉴定报告的效力及使用方式。