微信转给儿子的钱注明借款是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律关系角度：在法律上，借款关系是一种合同关系，只要双方存在真实的借款合意，即一方愿意出借资金，另一方愿意接受资金并承诺还款，这种合同关系就可能成立。在微信转账时注明是借款，这可以视为双方对借款这一事实达成了一致的意思表示，形成了书面的证据（虽然是电子形式），能够证明双方之间存在借款的法律关系。例如，父亲在微信转账时备注“借款给儿子用于购房”，儿子接收了这笔款项，这就表明双方对于这笔钱是借款关系达成了共识。
2. 证据效力角度：微信转账记录以及备注信息属于电子数据证据，在符合一定条件的情况下具有法律效力。根据相关法律规定，电子数据作为证据应当满足真实性、关联性、合法性的要求。如果微信转账记录和备注信息能够清晰地显示转账的时间、金额、用途（借款），并且能够证明是双方真实的意思表示，没有被篡改或伪造，那么就可以作为有效的证据来证明借款关系的存在。比如，在发生纠纷时，父亲可以提供微信转账记录和备注信息，作为要求儿子还款的证据。
3. 实际操作角度：虽然注明借款是合法的，但在实际操作中，为了更好地保障自己的权益，还可以采取一些额外的措施。例如，可以要求儿子出具书面的借条，明确借款的金额、利息、还款时间等重要条款；或者通过银行转账的方式进行借款，因为银行转账记录通常更加规范和详细，能够更好地证明借款的事实。

如果在借款过程中遇到任何问题，比如儿子不承认借款、拒绝还款等，都可以随时向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和解决方案。