“小三”怀孕后能否告男方，这取决于具体的情况和诉求，不能一概而论。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、民事权益角度
抚养费支付：
- 如果孩子出生且确系男方的子女，根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十一条，非婚生子女与婚生子女享有同等权利，不直接抚养非婚生子女的生父或生母应负担子女的生活费和教育费，直至子女能独立生活为止。因此，“小三”作为孩子的母亲，有权以孩子的名义起诉男方，要求支付抚养费。但需注意，必须提供充分的证据，如亲子鉴定等，来证明男方与孩子的亲子关系。
相关费用补偿：
- “小三”因怀孕产生的医疗费用（如产检费、人流手术费等）和营养费等合理支出，若这些费用是因与男方的关系直接导致的，可以起诉男方要求其分担部分费用。但同样需要提供充分的证据证明费用的合理性和关联性。对于所谓的“青春损失费”等没有明确法律依据的赔偿请求，法院一般不会支持。
身体损害赔偿：
- 若“小三”因怀孕导致身体受到损害，如引发疾病等，且能证明损害结果与男方行为之间存在因果关系，她可以基于侵权责任向男方主张赔偿。
二、刑事权益角度
重婚罪：
- 如果男方在有配偶的情况下与“小三”以夫妻名义共同生活，并且“小三”对此明知，双方都可能涉嫌重婚罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条，有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的，处二年以下有期徒刑或者拘役。此时，“小三”可以收集相关证据向法院提起刑事自诉，追究男方重婚罪的刑事责任。若“小三”不知男方有配偶而与其以夫妻名义共同生活，则不构成重婚罪，但可以向公安机关报案，由司法机关追究男方的刑事责任。
强奸罪：
- 若男方违背“小三”意志，使用暴力、胁迫等手段与之发生性关系导致怀孕，则男方可能构成强奸罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百三十六条，以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。此时，“小三”可以向公安机关报案，依法追究男方的刑事责任。
三、实际操作建议
- 证据收集：在实际诉讼中，证据的收集至关重要。例如，主张抚养费需证明孩子与男方的亲子关系；主张人身损害赔偿需提供受伤的相关证据等。因此，“小三”在决定起诉前，应尽可能收集并保存好相关证据。
- 法律咨询：鉴于此类案件涉及复杂的情感和法律关系，建议“小三”在决定起诉前充分咨询专业律师（即我）的意见，明确了解自己的权利和义务以及可能的法律后果。
- 长远考虑：在做出决策时，“小三”应综合考虑孩子的未来和自身的长远利益，做出明智的选择。例如，是否要生下孩子、是否要追求男方的刑事责任等都需要慎重考虑。
总结来说，“小三”怀孕后能否告男方以及能主张哪些权利，取决于具体的事实情况和证据状况。在处理此类问题时，应综合考虑民事、刑事等多方面的法律规定和实际情况。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。