在分居两年后提起离婚诉讼时，财产的分割确实是一个核心且复杂的问题，它涉及多个法律知识点和实际操作细节。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确财产性质
首先，我们需要明确哪些财产属于夫妻共同财产，哪些属于个人财产。
夫妻共同财产：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，如工资、奖金、劳务报酬、生产经营投资收益、知识产权收益等，均属于夫妻共同财产。这些财产在离婚时原则上应予以分割。
个人财产：一方的婚前财产、因人身损害获得的赔偿或补偿、遗嘱或赠与合同中确定只归一方的财产、一方专用的生活用品等，则属于夫妻一方的个人财产，离婚时不参与分割。
二、财产分割原则
在分割财产时，我们应遵循以下原则：
协商优先：夫妻双方应首先通过协商，自行决定如何分割共同财产。只要协商内容真实、合法，不损害他人权益，即具有法律效力。
法院判决原则：若协商不成，则由人民法院根据财产具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。法院在判决时会综合考虑双方的经济状况、子女抚养需要、婚姻期间贡献及过错行为等因素。
三、分居期间财产的特殊考虑
分居期间所得的财产，原则上仍属于夫妻共同财产，除非双方有书面约定分居期间各自所得财产归各自所有。这种约定对双方具有法律约束力。因此，在分居期间，如果双方没有特别的约定，那么所得财产仍然需要按照夫妻共同财产的原则进行分割。
四、具体财产类型的分割方式
对于不同类型的财产，分割方式也有所不同：
房产：共同购买的房产，可根据协商或法院判决进行分割。例如，一方获得所有权并给予另一方经济补偿，或将房屋出售并平分售房款。婚前购买但婚后共同还贷的房产，一般归婚前购房方所有，但婚后还贷部分及对应增值部分需补偿给另一方。
存款：银行存款一般平均分割。若一方存在转移、隐匿存款等行为，法院在分割时可对该方少分或不分。
车辆：车辆的分割方式与房产类似，可协商或由法院判决。
其他财产：家具、家电等生活用品根据实际使用情况和财产来源进行合理分割；投资收益、股权等财产则需根据具体情况评估并分割。
五、特殊情况的处理
在财产分割过程中，还可能遇到一些特殊情况：
涉及债务的财产分割：夫妻共同债务应共同偿还。分割财产时，需同时考虑债务的承担问题。若共同财产不足清偿，由双方协议或法院判决清偿方式。
隐藏、转移、变卖等不当行为：如一方在离婚时实施隐藏、转移、变卖、毁损、挥霍夫妻共同财产等行为，或伪造债务企图侵占另一方财产，可少分或不分财产。离婚后发现的，可向法院提起诉讼，请求再次分割。
六、实际操作建议
为了确保财产分割的公平性和合法性，我建议您：
收集证据：分居期间应妥善保管相关财产证据，如房产证、银行流水、购车合同等，以证明自己的主张。
寻求专业帮助：财产分割问题复杂且敏感，建议您咨询专业律师，以确保自身权益得到保障。律师可以根据您的具体情况，提供个性化的法律建议和指导。
综上所述，分居两年离婚时的财产分割需综合考虑多种因素，并严格遵循法律法规进行。通过明确财产界限、遵循分割原则、妥善处理特殊情况，并寻求专业帮助，您可以更有效地维护自己的合法权益。