侵占水闸工程保护地的行为属于违法行为，需根据具体情况采取相应的法律措施进行处理，具体处理方式如下：

1. 行政责任追究：

   • 水闸工程保护地属于水利工程设施保护范围，侵占行为违反了《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国防洪法》以及《中华人民共和国河道管理条例》等相关法律法规。
   • 水利主管部门或相关行政管理部门有权对侵占行为进行查处，责令停止违法行为，限期恢复原状，并可处以罚款。罚款金额根据侵占面积、情节严重程度及造成的后果等因素确定。

2. 民事责任承担：

   • 若侵占行为导致水闸工程设施损坏或影响其正常运行，侵占者需承担民事赔偿责任，包括修复费用、因停运造成的经济损失等。
   • 水闸工程管理单位或相关权利人有权要求侵占者停止侵害、排除妨碍、恢复原状，并赔偿损失。

3. 刑事责任追究：

   • 在极端情况下，若侵占行为情节严重，构成犯罪的，如破坏水利工程设施罪，将依法追究刑事责任。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，破坏重要水利工程设施的，可处三年以上十年以下有期徒刑；造成特别严重后果的，可处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。

4. 具体处理步骤：

   • 发现与举报：水闸工程管理单位或相关人员发现侵占行为后，应及时向水利主管部门或相关行政管理部门举报。
   • 调查与取证：相关部门接到举报后，应立即展开调查，收集证据，确认侵占事实。
   • 处理与执行：根据调查结果，相关部门依法作出处理决定，并监督执行。对于拒不执行处理决定的，可申请人民法院强制执行。

5. 预防措施：

   • 加强水闸工程保护地的宣传教育，提高公众对水利工程设施保护的认识。
   • 完善水闸工程保护地的管理制度，明确保护范围、管理责任及处罚措施。
   • 定期对水闸工程保护地进行巡查，及时发现并制止侵占行为。

建议：若您发现有人侵占水闸工程保护地，请及时向当地水利主管部门或相关行政管理部门举报，并配合相关部门的调查工作。同时，您也可以咨询我，了解更具体的法律程序和维权方式。