合同原件一式两份，其中一份遗失的情况下，首先不必过于担心，因为合同的有效性并不完全依赖于原件的数量，而是取决于合同的内容以及双方当事人的真实意思表示。不过，为了确保合同的顺利履行和避免潜在的法律风险，以下是一些具体的建议和措施：
一、合同效力的确认
合同内容完整且双方认可：如果合同内容完整，且双方当事人都认可合同的内容，那么即使其中一份原件遗失，合同仍然具有法律效力。因为合同的效力主要取决于双方当事人的真实意思表示和合同内容的合法性，而不是原件的数量。
补签或确认合同：为了增强合同的证明力，双方可以协商补签一份合同或者出具一份书面确认书，明确双方对原合同内容的认可和继续履行的意愿。这样，即使原件遗失，也有其他书面证据可以证明合同的存在和内容。
二、遗失原件的处理
及时通知对方：一旦发现合同原件遗失，应立即通知对方当事人，并说明情况。这有助于双方共同采取措施，防止合同内容被篡改或滥用。
收集其他证据：除了合同原件外，还可以收集其他与合同相关的证据，如履行合同的凭证、双方往来的邮件、短信等。这些证据可以在必要时证明合同的存在和内容。
考虑公证或见证：如果条件允许，可以对补签的合同或确认书进行公证或见证。公证或见证可以增强证据的证明力，使其在法律上更具说服力。
三、法律风险的防范
完善合同管理：为了避免类似情况的再次发生，建议完善合同管理制度，确保合同原件的安全保存。可以指定专人负责合同的保管和归档工作，并建立合同管理台账，记录合同的签订、履行和变更等情况。
加强法律意识：双方当事人应加强法律意识，了解合同的重要性和法律效力。在签订合同时，应认真阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保障。在履行合同过程中，应遵守合同约定，及时履行自己的义务。
四、特殊情况下的处理
如果遗失的合同原件涉及重要权益：如涉及大额交易、知识产权等，建议立即咨询专业律师，评估法律风险，并采取相应的法律措施。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助当事人维护自己的合法权益。
如果对方不认可合同内容：在遗失原件且对方不认可合同内容的情况下，可能需要通过法律途径解决争议。此时，应收集其他证据来证明合同的存在和内容，并咨询专业律师以制定合适的诉讼策略。
总之，合同原件一式两份其中一份遗失并不必然导致合同无效或无法履行。关键在于双方当事人的真实意思表示和合同内容的合法性。为了确保合同的顺利履行和避免潜在的法律风险，建议采取上述措施来加强合同管理和防范法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。