核心结论：公司可先内部核查转账原因，再根据不同情况采取拒绝退回并明确告知对方、退回款项、报警或寻求法律帮助等措施。以下是具体情况分析：

1. 内部核查转账原因
   • 公司首先应迅速开展内部调查，确定这笔0.01元的转账来源和目的。查看公司的财务记录、银行流水，与相关财务人员、可能涉及的员工进行沟通，了解是否为公司内部操作失误，比如财务系统故障、员工误操作等导致这笔小额转账。
   • 同时，也要排查是否存在员工与小额贷款催债方勾结，试图通过这种异常方式给公司造成困扰或者有其他不当目的的情况。
2. 若为催债方恶意骚扰
   • 拒绝退回并明确告知：如果确认是小额贷款催债方故意以这种小额转账的方式对公司进行骚扰，公司可以拒绝退回这0.01元，并且通过书面形式（如律师函或者正式的公司函件）明确告知催债方，公司的主体与员工个人债务无关，要求其立即停止这种不当行为，不得再以任何形式对公司进行骚扰。
   • 保留证据并报警：公司要保留好相关的转账记录、催债方联系公司的记录（如电话录音、短信、邮件等）作为证据。如果催债方的行为严重影响到公司的正常经营秩序，比如频繁打电话、发短信干扰公司工作，公司可以向公安机关报警，以维护自身的合法权益。
3. 若为操作失误导致
   • 退回款项：如果经过调查发现是催债方操作失误将款项转到了公司账户，从道德和法律的角度，公司应该将这0.01元退回给对方。可以通过银行转账的方式，按照对方提供的正确账户信息进行退回，并保留好退回的凭证。
   • 沟通说明情况：在退回款项的同时，公司可以与催债方进行沟通，说明情况，避免对方再次出现类似的错误操作，同时也表明公司对于员工个人债务问题的立场，即公司不会介入员工个人债务纠纷。
4. 若涉及员工违规行为
   • 内部处分员工：如果发现是公司员工与催债方串通，利用公司账户进行不当操作或者有其他违规行为，公司应根据内部的规章制度对涉事员工进行相应的处分，如警告、罚款、解除劳动合同等，以维护公司的管理秩序和声誉。
   • 追究法律责任：如果员工的行为给公司造成了经济损失或者其他严重后果，公司可以考虑通过法律途径追究员工的法律责任，要求员工赔偿公司的损失。