结论前置：关于您提出的“协议书证明孩子和孩子父亲没关系怎么写”这一问题，首先需要明确的是，在法律上，亲子关系的确立或否认通常需要通过专业的法律程序和证据来确认，而非仅凭一纸协议书。不过，若您确实希望就某些特定情况（如非生物学父亲与孩子之间的法律关系澄清）制定一份协议书，以下是一些建议和注意事项。
一、协议书的基本框架与内容
标题与双方信息：
- 标题应明确反映协议书的性质，如“关于确认非亲子关系的协议书”。
- 双方信息应包括姓名、身份证号码、联系方式等，确保协议书的主体明确。
声明与背景：
- 双方应明确声明，基于何种原因（如生物学检测、法律程序等）确认孩子与父亲之间不存在亲子关系。
- 简要描述背景情况，如双方的关系、孩子的出生情况等，以便为协议内容提供背景支持。
协议内容：
- 明确表述双方确认孩子与父亲之间不存在亲子关系。
- 可以约定双方对此事保密，避免对孩子造成不必要的伤害或影响。
- 若涉及抚养、继承等法律问题，应明确双方的权利和义务，以及后续的处理方式。
法律效力与争议解决：
- 双方应明确协议书的法律效力，即双方均认可协议内容，并愿意承担由此产生的法律责任。
- 约定争议解决方式，如协商、调解、诉讼等，以便在发生争议时能够及时解决。
签字与日期：
- 双方应在协议书上签字，并注明签字日期，以确保协议书的真实性和有效性。
二、注意事项
法律程序的重要性：
- 亲子关系的确立或否认通常需要通过法律程序（如亲子鉴定、法院判决等）来确认。协议书虽然可以表达双方的意愿，但在法律上可能不具有直接确认亲子关系的效力。
- 若您希望彻底解决亲子关系问题，建议咨询专业律师，了解相关法律程序，并依法进行。
保护孩子权益：
- 在制定协议书时，应充分考虑孩子的权益和感受。避免在协议书中使用对孩子造成伤害或歧视的言辞。
- 若孩子已经具备一定认知能力，应尊重其意愿和感受，避免对其造成不必要的心理压力。
协议书的合法性与有效性：
- 协议书的内容应合法、合规，不得违反法律法规的强制性规定。
- 协议书应基于双方自愿、平等、公平的原则制定，确保双方的权利和义务得到平衡。
三、示例条款
以下是一个简单的示例条款，供您参考：
“双方确认，基于[具体原因，如生物学检测结果、法院判决等]，孩子[孩子姓名]与父亲[父亲姓名]之间不存在亲子关系。双方对此事保密，并承诺不向任何第三方透露。若因本协议产生任何争议，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可依法向人民法院提起诉讼。”
最后，我建议您在制定协议书前，先咨询专业律师的意见，以确保协议书的合法性和有效性。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。