针对您提出的“公司侵占村集体财产怎么处理”这一问题，我可以明确地告诉您，侵占集体资产是违法行为，必须受到法律的制裁。为了确保村集体的合法权益得到有效维护，我们可以依法采取以下措施来处理这一问题：
一、初步处理与证据收集
- 协商解决与调查取证：
- 首先，您可以尝试与公司进行协商，明确要求其返还被侵占的村集体财产，并告知其行为的违法性及可能面临的法律后果。
- 同时，展开调查取证工作至关重要。您可以收集证人证言、财务记录、合同协议、监控录像等相关证据，这些证据将有助于确凿证明侵占事实的存在。
二、法律途径选择
（一）民事途径
- 提起民事诉讼：
- 若协商无果，村集体组织可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明侵占行为的存在以及村集体组织的合法权益。这些证据可以包括资产权属证明、侵占事实的证据等。
- 如果法院认定侵占行为成立，它将判决公司返还被侵占的财产，并可能要求其赔偿因此造成的损失。
（二）行政途径
向行政部门举报：
- 您还可以向农业农村部门、乡镇政府或街道办事处等相关管理部门进行举报。
- 这些部门有权对集体资产的管理和使用情况进行监督检查。接报后，它们将展开调查，并在查证属实后依法对侵占公司作出行政处罚，如责令改正、退还资产、罚款等。
寻求审计监督：
- 村集体组织可以申请对集体资产进行专项审计，特别是针对被侵占的部分。
- 审计结果将作为处理侵占问题的重要依据，为后续的法律行动提供有力支持。
（三）刑事途径
向公安机关报案：
- 如果侵占行为达到一定的严重程度，可能涉嫌犯罪，如职务侵占罪、侵占罪等。
- 在这种情况下，村集体组织可以向公安机关报案，并提供所收集的证据和详细情况说明。
- 公安机关将依法立案侦查，对相关嫌疑人进行传唤和讯问。
刑事诉讼：
- 侦查终结后，公安机关会将案件移送检察院审查起诉。
- 检察院认为犯罪事实清楚、证据确实充分的，会向法院提起公诉。
- 法院审理后，如果认定被告人构成犯罪，将根据法律规定判处相应刑罚，并判令其退赔村集体资产的损失。
三、执行与监督
- 执行判决：一旦判决生效，如果公司不履行判决义务，您可以向法院申请强制执行。法院将采取措施确保判决得到执行，从而保障村集体的合法权益。
- 持续监督：此外，村集体组织应加强对资产的管理和监督，建立健全的资产管理制度和监督机制，以防止类似侵占行为再次发生。
四、典型案例参考
您可以参考一些典型的侵占集体资产案例，如“仲某某、尚某某、高某某职务侵占案”及“某富硒合作社非法占用基本农田案”等。这些案例表明，法律对侵占集体资产的行为将予以严厉打击，从而维护集体的财产权益。
综上所述，处理公司侵占村集体财产的问题需要依法进行，通过综合运用民事、行政和刑事途径来确保村集体的财产权益得到有效保护。同时，加强内部管理和监督也是预防侵占行为的重要措施。希望这些建议能对您有所帮助。