在起诉离婚的案件中，若您因怀疑对方存在转移、隐匿夫妻共同财产等行为，确实有权向法院申请查询对方的银行流水，但关于查询银行流水的具体收费问题，这并非由单一因素决定，而是涉及多个方面，以下是对此问题的详细解答：
一、查询银行流水的费用构成
法院调查取证费用：
- 法院在受理您的查询申请后，若认为有必要且符合法定条件，会依法向相关银行发出调查令。这一过程中，法院本身通常不会直接向您收取查询费用，但整个调查取证过程可能涉及一定的行政成本，不过这些成本一般不直接由申请人承担。
银行可能收取的费用：
- 银行在响应法院的调查令时，可能会根据自身的规定收取一定的费用，如查询费、复制费等。这些费用因银行而异，且可能根据查询的时间范围、账户数量等因素有所不同。
- 需要注意的是，这些费用并非由法院直接收取，而是由银行根据其服务收费标准来收取。因此，在申请查询前，您可以向相关银行咨询其具体的收费标准。
二、申请查询银行流水的流程与注意事项
提交书面申请：
- 您需要向受理案件的法院提交书面申请，详细说明查询银行流水的目的、必要性和相关线索（如开户银行、大致时间段等）。
法院审查与调查取证：
- 法院会对您的申请进行严格审查，考虑是否属于离婚案件的必要证据、是否侵犯对方合法权益等因素。
- 若法院认为申请合理且与案件紧密相关，会依法向相关银行发出调查令。
尊重隐私权与合法使用证据：
- 在申请查询银行流水时，您应尊重对方的隐私权，不得滥用查询权利。
- 查询到的银行流水应作为合法证据使用，结合其他证据共同形成完整的证据链，以支持您的主张。
三、建议与指导
- 咨询专业律师：在整个过程中，建议您咨询专业律师以获取具体的法律指导和帮助。律师可以根据您的具体情况，为您提供更详细的费用预估和申请流程指导。
- 了解银行收费标准：在申请查询前，您可以向相关银行咨询其查询银行流水的收费标准，以便做好预算和准备。
综上所述，起诉离婚时申请查询对方银行流水的费用并非固定不变，而是涉及多个方面。为了确保您的权益得到充分保障，建议您在申请查询前咨询专业律师，并了解相关银行的收费标准。