在单位电瓶车与电动汽车发生碰撞且当时未报警的情况下，您可以按照以下步骤来妥善处理这一事故，以确保您的权益得到妥善维护：
一、尽快补报事故
尽管事故现场可能已经有所变动，但您仍应尽快向当地的交警部门报案。在报案时，请详细说明事故发生的时间、地点、双方车辆的基本信息以及事故的大致经过。交警部门会根据您提供的信息进行调查，并尽可能还原事故真相，为后续的责任认定提供依据。
二、积极收集证据
为了辅助交警进行责任认定，您需要积极寻找并收集相关证据。这包括：
目击证人：寻找事故发生时的目击者，并获取他们的联系方式。他们的证言对于明确事故责任至关重要。
监控录像：如果事故发生在有监控的区域，尝试调取附近的监控录像。监控录像可以直观地展示事故发生的经过，为责任认定提供有力支持。
现场照片：如果可能的话，拍摄事故现场的照片，包括车辆损坏情况、碰撞位置等。这些照片可以作为事故现场的直观证据。
三、责任划分与协商赔偿
责任划分：根据收集到的证据，交警部门或双方当事人可以共同判断双方在事故中的过错程度。例如，是否存在闯红灯、逆行、超速等违规行为。根据过错程度，确定各自应承担的责任比例。
协商赔偿：在明确责任后，双方应就赔偿问题进行协商。赔偿内容主要包括车辆维修费用、医疗费用（如果有人受伤）、误工费等。双方应共同评估损失，并确保所有费用均有明确凭证支持。如果能够达成一致意见，建议签订书面赔偿协议，明确事故经过、责任认定、赔偿金额及支付方式等内容，并由双方签字确认。
四、保险理赔
如果您的电瓶车购买了相关保险（如意外险、第三者责任险等），您应及时向保险公司报案，并提供事故的详细信息及相关证据。按照保险公司的要求办理理赔手续，以获得相应的保险赔偿。这可以减轻您的经济负担，并为您提供一定的保障。
五、法律途径解决纠纷
如果双方无法就赔偿问题达成一致意见，或者对方拒绝赔偿，您可以考虑向人民法院提起民事诉讼。在起诉时，您需要准备充分的证据以证明事故的发生经过、自己的损失以及对方应承担的责任。法院将根据事实和法律规定进行判决，以维护您的合法权益。
六、保持冷静与理智
在处理事故及后续纠纷过程中，请保持冷静和理智。避免与对方发生争执或冲突，以免加剧矛盾。同时，要尽可能多地收集和保留相关证据，以便为后续的法律程序提供支持。
总之，即使事故发生时未报警，您仍可以通过报警、收集证据、协商赔偿或诉诸法律等途径来维护自己的合法权益。如有需要，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。