蓝牌轻便摩托车闯红灯两次的处罚需分情况讨论，具体如下：

1. 行政处罚层面
   根据《道路交通安全法》第90条及《机动车驾驶证申领和使用规定》，闯红灯属于“驾驶机动车违反道路交通信号灯通行”的违法行为，每次处罚标准为：
   

• 罚款200元；
  
• 记6分（依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第10条）。
  若两次闯红灯行为被分别查获（如不同时间、地点），则需累计处罚，即罚款400元、记12分。若在同一执法过程中被认定为连续违法行为（如短时间内连续闯两个红灯），部分地区可能按一次违法行为从重处罚，但需以具体执法文书为准。

1. 驾驶证处理层面
   

• 若驾驶人持有的是C1及以上机动车驾驶证，累计记12分后，需在15日内参加交管部门组织的7天交通安全教育学习，并通过科目一考试后才能清分；若拒不参加学习或考试，公安机关将公告其驾驶证停止使用。
  
• 若驾驶人持有的是摩托车专用驾驶证（如E、F证），处理流程与C1证相同，但需注意：若驾驶证处于实习期（初次领证后12个月内），记满12分将直接注销实习资格，需重新考取。

1. 特殊情形补充
   

• 车辆性质影响：若蓝牌轻便摩托车被认定为“机动车”（需满足发动机排量≤50ml、设计时速≤50km/h等标准），则按上述机动车处罚；若被认定为“非机动车”（如部分超标电动车未纳入机动车管理），则处罚标准可能降低（如警告或5-50元罚款），但需以当地交管部门认定为准。
  
• 累犯加重：若驾驶人年内多次因闯红灯被处罚，部分地区可能依据《道路交通安全法》第90条“从重处罚”原则，提高罚款金额（如从200元升至500元），但需以地方性法规或执法实践为准。

建议：若已收到两次闯红灯处罚通知，需尽快处理违章（可通过“交管12123”APP或线下窗口），避免因逾期未处理导致滞纳金（每日按罚款数额的3%加处，最高不超过本金）或驾驶证被扣留。如有异议，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。