结论：起诉“小三”一般不能分两次进行，但具体是否可以分两次起诉，需根据起诉的具体事项和法律关系来判断。以下从不同角度进行分析：
一、从起诉事项的角度分析
如果起诉“小三”是基于侵权行为：
- 例如，“小三”侵犯了您的名誉权、隐私权等，您可以选择就某一侵权行为提起一次诉讼。
- 如果后续又发现“小三”有其他侵权行为，且这些侵权行为与之前起诉的侵权行为不是同一法律关系或不是基于同一事实，那么您可以再次提起诉讼。但这种情况并不等同于“分两次起诉同一事项”，而是针对不同事项的分别起诉。
如果起诉“小三”是基于财产纠纷：
- 例如，您认为“小三”与您的配偶存在不正当经济往来，侵占了您的夫妻共同财产，您可以就这部分财产提起一次诉讼。
- 如果在诉讼过程中或诉讼后，您又发现了其他被侵占的财产，且这些财产与之前起诉的财产不是同一笔或不是基于同一事实，理论上您可以再次提起诉讼。但同样，这并非“分两次起诉同一事项”。
二、从法律程序的角度分析
- 在民事诉讼中，通常遵循“一事不再理”的原则，即对于同一事实和同一法律关系，法院已经作出判决的，当事人不得再次就同一事实和同一法律关系向法院提起诉讼。
- 因此，如果您已经就某一事项起诉了“小三”，并且法院已经作出了判决，那么您通常不能再次就同一事项提起诉讼。
三、特殊情况下的考虑
- 如果在第一次起诉后，出现了新的事实或证据，这些新的事实或证据足以改变原判决的结果，那么您可以在法定期限内申请再审或提起新的诉讼（但需注意，这并非简单的“分两次起诉”，而是基于新事实或证据的救济程序）。
- 另外，如果“小三”的行为涉及多个法律关系或多个侵权行为，且这些法律关系或侵权行为之间相对独立，那么您可能可以分别就这些法律关系或侵权行为提起诉讼。但这同样不是“分两次起诉同一事项”，而是针对不同法律关系或侵权行为的分别诉讼。
四、法律建议
- 在决定是否起诉“小三”以及如何起诉时，建议您先咨询专业律师，明确您的诉求和法律依据。
- 律师会根据您的具体情况，分析起诉的可行性、可能的结果以及诉讼策略等，帮助您做出更明智的决策。
总结：起诉“小三”一般不能简单地“分两次”进行，而是需要根据起诉的具体事项和法律关系来判断。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。