小区设置电梯卡是否合法，需结合具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
合法情况
合同有明确约定：
- 如果业主与物业公司签订的《物业服务合同》中明确约定了物业公司有权采取电梯卡等方式管理小区公共设施，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么物业设置电梯卡具有合同基础，属于合法行为。这种做法通常旨在维护小区安全秩序和保障业主正常生活环境。例如，合同中可能规定，为了提升小区安全管理水平，物业有权安装电梯卡系统，限制非住户使用电梯，业主在签订合同时已知晓并接受这一条款。
出于合理目的且程序合规：
- 物业若为了提升小区安全管理、控制外来人员进入等合理目的，在征得业主大会或业主委员会同意后实施电梯刷卡管理，也是合法的。这种情况下，物业的行为符合多数业主的利益，且经过了合法的决策程序。比如，物业先向业主大会提出安装电梯卡的提案，经过讨论和表决，获得了三分之二以上业主的同意，并形成了书面决议，之后才进行安装。
不影响业主基本权益：
- 物业设置电梯卡不得严重影响业主正常使用电梯，如限制使用次数、楼层等。如果电梯卡系统只是用于识别住户身份，而不限制其使用电梯的次数和楼层，那么这种设置通常是合法的。
违法情况
侵犯业主权益：
- 未经业主同意或违反合同约定私自设置电梯卡，限制了业主对电梯的正常使用，侵犯了业主的合法权益。特别是当此举被用作强制业主交纳物业费或其他费用的手段时，更是严重违法。例如，物业未经业主大会同意，擅自安装电梯卡系统，并要求业主必须缴纳物业费才能获得电梯卡，否则无法使用电梯，这种行为就侵犯了业主的合法权益。
违反法律法规：
- 根据《物业管理条例》及《中华人民共和国民法典》的相关规定，物业公司应按照物业服务合同的约定提供服务，不得擅自改变公共建筑和共用设施（如电梯）的用途。私自设置电梯卡改变了电梯的原有使用方式，如果未经业主大会同意或违反相关法律法规，就可能构成违法。此外，如果电梯卡系统在紧急情况下（如火灾、急救）阻碍了人员快速疏散，且物业未制定有效的应急措施来保障安全疏散，那么物业设置电梯卡的行为也存在过错，可能被认定违法。
存在安全隐患：
- 若电梯卡系统存在技术缺陷或未定期维护，导致系统故障或困人事故，那么物业设置电梯卡的行为也可能构成违法。因为这种行为既违反了《特种设备安全监察条例》关于电梯维保的强制性要求，也构成对业主生命健康权的威胁。
应对措施
协商调解：业主可通过业委会与物业进行协商，要求恢复电梯的正常使用，并停止侵犯业主权益的行为。在协商过程中，业主可以提出自己的合理诉求，如要求物业提供电梯卡系统的合法依据、说明设置目的和使用方法等。
行政投诉：若协商无果，业主可向房产局物业管理部门或相关行政主管部门投诉，请求介入处理。在投诉时，业主应提供相关证据，如物业服务合同、业主大会决议、电梯卡系统照片等，以支持自己的诉求。
法律维权：在必要时，业主可寻求法律援助，通过诉讼途径要求物业公司承担违约责任，并赔偿因此造成的损失。同时，业主也可以向消费者协会等组织投诉，寻求帮助和支持。
综上所述，小区设置电梯卡是否合法取决于多种因素，包括合同约定、程序合规性、是否影响业主基本权益以及是否违反法律法规等。业主在面对此类问题时，应积极维护自身权益，通过合法途径解决问题。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。