结论：软件著作权登记后，目前确实不再默认发放纸质证书，而是提供电子证书作为官方证明文件。不过，在特定情况下，申请人仍可申请获取纸质证书。

详细解释与背景：

1. 电子证书的普及：

   • 随着数字化进程的加速，国家版权局为了提升服务效率、减少纸质文件的使用，并方便申请人快速获取证书，已经逐步推行软件著作权登记的电子证书制度。
   • 电子证书与纸质证书具有同等的法律效力，均可以作为软件著作权归属的官方证明。

2. 纸质证书的申请：

   • 尽管电子证书已成为主流，但在某些特定情况下，如申请人因特殊需求（如企业内部分发、存档等）确实需要纸质证书时，可以向国家版权局或相关登记机构提出申请。
   • 申请纸质证书可能需要遵循特定的流程，如填写申请表、提供必要的证明文件等，并可能需要支付额外的费用。

3. 法律背景与依据：

   • 软件著作权登记是保护软件创作者权益的重要手段，其登记证书是证明软件著作权归属的官方文件。
   • 根据《计算机软件保护条例》及相关规定，软件著作权登记证书（无论是电子还是纸质）均具有法律效力，可以作为软件著作权归属的证明。

4. 实际操作建议：

   • 如果您需要软件著作权登记证书，建议首先了解并接受电子证书的形式，因为它更快捷、更环保。
   • 如果您确实需要纸质证书，可以向国家版权局或相关登记机构咨询具体的申请流程和要求，并按照要求准备相关材料。

后续行动建议：

• 如果您对软件著作权登记流程、电子证书与纸质证书的申请等有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。
• 在申请软件著作权登记时，请确保您的软件符合登记条件，并准备好相关的申请材料，以加快登记进程。