针对您提出的“非车主本人违规扣12分怎么处理”的问题，这是一个涉及交通法规与处理流程的重要事项，我将为您详细解答。

一、明确责任与核实情况

首先，需要明确的是，交通违章的扣分应当扣在实际驾驶人的驾照上，而非车主。如果您发现自己因非本人驾驶行为而被扣分，特别是扣了12分这样严重的情况，您应立即采取措施核实违规事实。这包括通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如交管12123）或亲自前往交管部门，查询具体的违章时间、地点、行为及处罚情况。

二、准备证明材料

在核实了违规事实后，您需要准备充分的证明材料来证明您并非实际驾驶人。这些材料可能包括：

1. 不在场证明：如出差证明、上班打卡记录、医院就诊记录等，证明您在违章发生时不在现场。
2. 实际驾驶人信息：如果知道实际驾驶人是谁，应获取其相关信息，并鼓励其承认驾驶行为。
3. 监控录像与行车记录仪：如果有监控录像或行车记录仪视频，这些客观证据可以清晰地证明实际驾驶情况。
4. 证人证言：如有目击者或其他知情人士，可请其提供书面证言。

三、与交管部门沟通

携带好相关证件（机动车行驶证、驾驶证、身份证）及准备好的证据材料，您应前往交警大队或支队违法处理窗口，向工作人员说明情况并提交材料。在沟通过程中，保持冷静和礼貌，详细阐述您的立场和证据。

四、申请复议或更正处罚

如果交警部门在初步沟通后未予更正处罚，您有权在规定时间内（一般为60日内）向上一级公安机关交通管理部门或同级人民政府申请行政复议。在复议过程中，您需要提交所有相关证据，并详细阐述您的理由。如果复议结果仍不满意，您还可以在6个月内直接向人民法院提起行政诉讼。

五、特别注意事项

1. 合法合规处理：在整个处理过程中，务必确保所有手续合法合规，避免提供虚假材料或进行违规操作。
2. 及时关注处理进度：定期查看车辆的违章信息和扣分情况，及时与交管部门沟通处理进度，以避免影响车辆使用和个人驾驶记录。
3. 加强车辆管理：加强对车辆使用的管理，防止他人未经授权使用车辆导致不必要的扣分和法律风险。例如，可以通过设置车辆使用权限、安装GPS追踪设备等方式来加强管理。

六、关于使用交管12123处理非本人车辆违章的说明

虽然交管12123 APP提供了便捷的处理非本人车辆违章的方式，但在此情况下（即非车主本人违规扣12分），由于涉及严重的扣分和可能的法律责任问题，我建议您亲自前往交管部门处理，并携带好所有相关证据材料。这样更能确保您的权益得到妥善维护。

综上所述，处理非车主本人违规扣12分的情况需要耐心、细心和专业的法律知识。遵循上述步骤和注意事项，您将能够更有效地维护自己的合法权益。